Die Erzählung von Zetsumetsu Dōbutsu Monogatari konzentriert sich auf Tiere, die durch menschliches Handeln zum Aussterben getrieben wurden, und untersucht die spezifischen historischen Umstände und menschlichen Verhaltensweisen, die zu ihrem endgültigen Verschwinden von der Erde führten. Das Manga argumentiert, dass im Gegensatz zu prähistorischen Tieren wie dem Mammut, die von primitiven Vorfahren zum Überleben gejagt wurden, die dargestellten modernen Arten nicht aus Notwendigkeit, sondern aufgrund menschlicher Gier, Eitelkeit, Selbstsucht und dem unerbittlichen Streben nach Profit ausgerottet wurden. Das Werk dient als Aufzeichnung dieser Ereignisse und zielt darauf ab, die hässlicheren Aspekte der menschlichen Natur durch die tragischen Schicksale dieser verlorenen Kreaturen aufzudecken.

Die Geschichte wird in einer Reihe von episodischen Kapiteln erzählt, die jeweils einem anderen ausgestorbenen Tier oder Vogel gewidmet sind. Der erste Band umfasst acht Arten, darunter den Dodo von Mauritius, den massiven Stellerschen Seekuh, die Wandertaube, den Riesenalk, den Amerikanischen Bison (der knapp der völligen Ausrottung entging), den Pyrenäensteinbock, das Nördliche Breitmaulnashorn und den Japanischen Wolf. Jedes Kapitel rekonstruiert die Interaktion des Tieres mit den Menschen, vom ersten Kontakt und der Ausbeutung bis zum schließlichen Niedergang und dem Moment des endgültigen Verlusts. Ein zweiter Band setzt dieses Thema mit weiteren acht Arten fort, darunter der Beutelwolf (Thylacin), der Chinesische Flussdelfin (Baiji), der Riesenvogel Moa und die Pinta-Riesenschildkröte, und rahmt die Erzählung explizit als eine Geschichte, die mit der Gegenwart verbunden ist, und hinterfragt, warum die Menschheit Aussterben verursacht und ob eine Zukunft ohne es möglich ist. Ein dritter Band ist ebenfalls erhältlich und behandelt das Mammut, den Auerochsen und den Quagga.

Der Schauplatz wechselt mit jedem Kapitel zum spezifischen geografischen Ort und Zeitraum jedes Aussterbens, von abgelegenen Inseln wie Mauritius bis zu den Meeren des Nordpazifiks und den Wäldern Japans. Das Manga präsentiert durchgängig einen düsteren und trauernden Ton und konzentriert sich auf die unwiderrufliche Endgültigkeit des Aussterbens. Obwohl es auf historischen und wissenschaftlichen Fakten basiert und von dem Aussterbe-Spezialisten und Autor Tadashi Imaizumi betreut wird, verwendet die Erzählung kreatives Geschichtenerzählen, um das emotionale Gewicht dieser Ereignisse zu veranschaulichen. Der übergreifende Erzählbogen ist eine chronologische und thematische Erforschung des menschenverursachten Aussterbens, die von bekannten Warnbeispielen wie dem Dodo zu komplexeren Fällen übergeht und zum Nachdenken über die Beziehung der Menschheit zur natürlichen Welt und die moralische Verantwortung zur Verhinderung weiterer Verluste anregt.