"Bomber Girl" ist eine Manga-Serie, die in einer futuristischen Welt angesiedelt ist, in der die Menschheit durch eine mysteriöse Bedrohung, bekannt als die "Schwarzen Bomben", an den Rand der Auslöschung gebracht wurde. Diese Bomben sind intelligente Wesen, die sich von menschlicher Energie ernähren und die Fähigkeit besitzen, sich in menschliche Formen zu verwandeln. Die Überlebenden der Menschheit haben sich in isolierte Städte zurückgezogen, die durch Schutzbarrieren gesichert sind. Die Handlung dreht sich um eine Gruppe von jungen Frauen, die als "Bomber Girls" bezeichnet werden. Diese Mädchen sind mit speziellen Anzügen ausgestattet, die es ihnen ermöglichen, die Schwarzen Bomben zu bekämpfen, indem sie deren Energie absorbieren und neutralisieren.

Die Protagonistin der Serie ist Aya, ein junges Mädchen, das sich freiwillig als Bomber Girl meldet, um ihre Familie zu schützen. Aya wird in eine Einheit aufgenommen, die aus weiteren Bomber Girls besteht, darunter die erfahrene Anführerin Rina, die technisch versierte Miko und die kämpferische Yuki. Jedes Mädchen hat eine einzigartige Persönlichkeit und spezielle Fähigkeiten, die sie in die Gruppe einbringen. Zusammen müssen sie sich gegen die Schwarzen Bomben behaupten, die immer wieder versuchen, die Schutzbarrieren der Städte zu durchbrechen.

Im Laufe der Serie wird deutlich, dass die Schwarzen Bomben nicht nur einfache Feinde sind, sondern eine komplexe Geschichte und Motivation haben. Es gibt Hinweise darauf, dass sie möglicherweise von Menschen geschaffen wurden und dass ihre Existenz mit den Fehlern der Vergangenheit der Menschheit verbunden ist. Die Bomber Girls müssen nicht nur gegen die äußere Bedrohung kämpfen, sondern sich auch mit moralischen Dilemmata und den Konsequenzen ihrer Handlungen auseinandersetzen.

Die Handlung entwickelt sich durch eine Reihe von Missionen, bei denen die Bomber Girls immer wieder an ihre Grenzen stoßen. Dabei werden sowohl ihre körperlichen als auch ihre emotionalen Fähigkeiten auf die Probe gestellt. Die Serie thematisiert Themen wie Opferbereitschaft, Freundschaft und die Frage, was es bedeutet, Mensch zu sein. Die Charaktere wachsen im Laufe der Geschichte und lernen, mit ihren Ängsten und Schwächen umzugehen, während sie gleichzeitig versuchen, die Welt vor der endgültigen Zerstörung zu bewahren.