Im Jahr 2019 auf der Insel Tanegashima sind die Kindheitsfreunde Yashio Kaito und Senomiya Akiho die einzigen verbliebenen Mitglieder des Robotik-Clubs ihrer Oberschule, der von der Auflösung bedroht ist. Akiho möchte den Club unbedingt am Leben erhalten, weil er ihre letzte Verbindung zu ihrer älteren Schwester ist, einer Robotikerin, die verschwunden ist. Kaito hingegen interessiert sich weit mehr für das Online-Kampfspiel Kill Ballad Online als für den Bau von Robotern. Seine außergewöhnlichen Fähigkeiten in diesem Spiel erweisen sich als unerwartet nützlich, als der Club vor Herausforderungen steht, die schnelle Reflexe und kreative Problemlösungen erfordern.

Die Geschichte ist eine alternative Nacherzählung des Robotics;Notes-Visual-Novel, die sich auf die Figur Frau Kojiro konzentriert, eine brillante, aber sozial unbeholfene Programmiererin, die auch eine Hardcore-Fujoshi ist. Frau wird zu einer wichtigen Verbündeten, die ihre Hacking-Talente und Spieleentwicklungsexpertise in den kämpfenden Club einbringt. Zusammen mit anderen Rekruten wie dem professionellen Roboter-Kämpfer Subaru Hidaka und der Karate-Praktizierenden Junna Daitoku begibt sich das Team auf ein ehrgeiziges Projekt: den Bau einer originalgetreuen Nachbildung des Riesenroboters Gunvarrel aus einem klassischen Anime. Dies führt sie zum Gunbuild-1 und dem fortschrittlicheren Gunbuild-2, die sie mittels erweiterter Realität steuern.

Als Kaito tiefer in die Geheimnisse der Insel eintaucht, entdeckt er die Kimijima-Berichte, Dokumente, die der verstorbene Wissenschaftler Ko Kimijima hinterlassen hat und die einen katastrophalen Sonnensturm vorhersagen, der kurz davor steht, alles Leben auf der Erde auszulöschen. Er trifft auch auf zwei künstliche Intelligenzen, Airi und Sister Centipede, die ihn zur Wahrheit führen. Doch die Berichte sind eine Falle: Kimijima hat sein eigenes Bewusstsein in das Iru-O-System hochgeladen und arbeitet mit dem schattenhaften Komitee der 300 zusammen, um den Sonnensturm im Rahmen von Projekt Atum auszulösen. Das Komitee übernimmt die Kontrolle über das Tanegashima-Weltraumzentrum, entfesselt eine Welle von Roboter-Amokläufen in ganz Japan und stiehlt den experimentellen Kampfroboter SUMERAGI.

Als sich die Prophezeiung des Sonnensturms zu erfüllen beginnt, gehen überall Roboter durch, und Frau wird öffentlich für das Chaos verantwortlich gemacht. Kaito muss der KI Kimijima in einem letzten Match in Kill Ballad Online gegenübertreten, wo der Feind eine betrügerische Version von Gunvarrel einsetzt. Mit Hilfe von Verbündeten und dem verbesserten Super Gunbuild-1 steuert Kaito den Roboter, um SUMERAGI zu deaktivieren und Kimijimas KI zu löschen, wodurch der Plan des Komitees vereitelt wird. Die Clubmitglieder erweisen sich als unwahrscheinliche Helden, die Tanegashima und ihre Freundschaften gerettet haben.

In dieser alternativen Geschichte wird die Bindung zwischen Kaito, Akiho und Frau vertieft, und die Erzählung betont Frauens Perspektive, ihre Motivationen und ihre entscheidende Rolle im Kampf gegen die Verschwörung. Der Manga stellt Kaito zudem als einen wettbewerbsorientierteren und adrenalingeladenen Charakter dar, während die Motive des Antagonisten im Rahmen der Gaming-Kultur neu formuliert werden, was den Konflikt persönlich und auf den Kampf des Clubs fokussiert erscheinen lässt, gegen überwältigende Widrigkeiten zusammenzuhalten.