Die Oberschülerin Mana war sechs Jahre alt, als sie ihre Eltern verlor, und der Mann, der sie aufnahm und seitdem großzog, ist Kazuki, ein Mann ohne Blutverwandtschaft zu ihr. Die beiden haben immer allein zusammengelebt, und Mana ist aufgewachsen, indem sie Kazuki einfach als ihren Vater betrachtete. Doch als sie in die Pubertät kommt, beginnen sich ihre Gefühle für ihn von kindlicher Zuneigung zu romantischer Anziehung zu wandeln, und sie beginnt, den Mann hinter dem Elternteil zu sehen. Die Geschichte folgt Mana, während sie mit diesen neuen Emotionen ringt, unsicher, ob Kazuki sie jemals als etwas anderes als eine Tochter sehen könnte, während Kazuki sich seiner eigenen sich verändernden Wahrnehmung des von ihm großgezogenen Mädchens stellen muss.

Die Erzählung verfolgt die allmähliche Transformation ihrer Beziehung, wobei Mana schließlich ihre Liebe gesteht. Kazuki akzeptiert ihre Gefühle, setzt aber eine Grenze: Er möchte bis zu ihrem zwanzigsten Lebensjahr eine Vaterfigur bleiben, und besteht darauf, dass sie Zeit hat, zu wachsen und sich ihres eigenen Herzens sicher zu sein. Das Paar lebt unter diesem angespannten, unausgesprochenen Versprechen weiter zusammen und kämpft darum, ihre anhaltende elterliche Dynamik mit der unbestreitbaren romantischen Spannung, die nun zwischen ihnen besteht, in Einklang zu bringen.

Spätere Handlungsbögen, gesammelt unter der Fortsetzung Papa ga Otoko ni Kawaru Toki II, folgen Mana, die nun achtzehn ist und sich dem vereinbarten Alter nähert. Während sie das College-Leben meistert, verkompliziert ein kurzer Auftritt als lokale Berühmtheit durch einen Fernsehwerbespot die Dinge, und ein Kommilitone namens Shirai taucht auf, der in Kazuki Eifersucht weckt. Die Fortsetzung taucht tiefer in das Hin und Her zwischen Kazukis beschützenden Instinkten und seinem wachsenden Verlangen, Mana als Frau zu behandeln, ein, gipfelnd in Manas Vorschlag, einen Tag wie ein echtes Paar zu verbringen, um seine Verwirrung zu lindern. Die Serie erkundet die feine Linie zwischen familiärer Pflicht und romantischer Intimität, vor dem alltäglichen Hintergrund von Zuhause, Schule und sozialen Verpflichtungen.