"Aquadom" ist eine Manga-Serie, die in einer dystopischen Zukunft spielt, in der die Welt durch Umweltkatastrophen und den steigenden Meeresspiegel stark verändert wurde. Die Menschheit hat sich an die neuen Lebensbedingungen angepasst und lebt in schwimmenden Städten, die als Aquadome bezeichnet werden. Diese Städte sind autarke Ökosysteme, die von einer strengen Hierarchie und Kontrolle geprägt sind. Die Gesellschaft ist in Klassen unterteilt, wobei die Elite in den oberen Ebenen der Dome lebt, während die unteren Schichten in beengten und prekären Verhältnissen existieren.

Die Handlung konzentriert sich auf die Protagonistin Mira, eine junge Frau, die in den unteren Ebenen eines Aquadoms aufwächst. Mira arbeitet als Technikerin und ist spezialisiert auf die Wartung der lebenserhaltenden Systeme, die die Stadt am Laufen halten. Ihr Leben ändert sich schlagartig, als sie zufällig auf ein geheimes Projekt der Elite stößt, das darauf abzielt, die Ressourcen der unteren Schichten weiter auszubeuten, um die Privilegien der Oberschicht zu sichern. Dabei entdeckt sie auch die Existenz einer Widerstandsgruppe, die gegen die Unterdrückung kämpft und eine gerechtere Gesellschaft anstrebt.

Mira schließt sich dem Widerstand an und wird zu einer Schlüsselfigur im Kampf gegen die korrupte Führung des Aquadoms. Im Laufe der Geschichte wird ihr klar, dass die Probleme ihrer Welt tiefer liegen als sie zunächst dachte, und sie muss sich mit moralischen Dilemmata auseinandersetzen, während sie versucht, das Gleichgewicht zwischen persönlichem Überleben und dem Wohl der Gemeinschaft zu finden. Die Serie thematisiert dabei Fragen der sozialen Ungleichheit, Umweltzerstörung und die ethischen Konsequenzen technologischer Fortschritte.

Neben Mira spielen weitere Charaktere eine wichtige Rolle, darunter Kael, ein charismatischer Anführer des Widerstands, und Liora, eine Wissenschaftlerin, die sich mit den Folgen der Umweltkatastrophen auseinandersetzt. Die Beziehungen zwischen den Charakteren sind komplex und werden durch die Herausforderungen, denen sie gegenüberstehen, ständig auf die Probe gestellt. Die Handlung entwickelt sich durch politische Intrigen, technologische Konflikte und persönliche Entwicklungen der Figuren, wobei die Spannung durch die ständige Bedrohung durch die Elite und die fragilen Lebensbedingungen in den Aquadoms aufrechterhalten wird.