Seit Urzeiten wacht eine kosmische Entität namens Algol über die Menschheit. Um zu entscheiden, ob die Menschen der Erde würdig sind, ins All vorzudringen, wählt Algol drei Individuen aus und erweckt ihr verborgenes Potenzial, wodurch sie zu übermenschlichen Wesen namens Eliten werden. Die drei Auserwählten sind ein willensschwacher japanischer Mittelschüler namens Takiryu Taro, ein amerikanischer Säugling namens John Kowalski, der bereits über außergewöhnliche psychische Fähigkeiten wie Telepathie, Vorahnung und Teleportation verfügt, und ein skrupelloser internationaler Verbrecher, Elkenig Dangar.

Dangar nutzt seine neu gewonnene Macht sofort, um die Weltherrschaft anzustreben. Er erkennt, dass das Baby John der Schlüssel zu unbegrenzter Stärke ist, da John als einziger der drei Eliten über psychische Gaben verfügt. Dangar ermordet Johns Eltern und versucht, den Säugling zu entführen. Der dritte Elite, Taro, stellt sich ihm entgegen. Taro ist ein gewöhnlicher Junge, der Manga-Zeichner werden wollte, doch nun muss er seine gesteigerte Intelligenz und körperlichen Fähigkeiten einsetzen, um Dangar zu bekämpfen. Er entwickelt einen leistungsstarken Kampfanzug, der übermenschliche Stärke, Flugfähigkeit durch Schwerkraftkontrolle und kugelsicheren Schutz verleiht, und baut im Keller des Anwesens seines Verbündeten Dr. Solomon einen massiven Computer.

Dangar, der bereits eine kriminelle Organisation aufgebaut hat und später durch Gehirnwäsche seine Reihen vergrößert, setzt schreckliche Waffen ein. Er verwendet ein Gewehr, das Miniatur-Atombomben namens Pencil-Baryon-Geschosse abfeuert, Teile Tokios verwüstet und ihm den Beinamen „Atombomben-Mann“ einbringt. Die Vereinten Nationen erklären ihn zum Feind Nummer eins der Menschheit. Taro wird von Judy Solomon, der Tochter eines Wissenschaftlers, der psychische Phänomene erforscht, sowie von einem Polizeiinspektor unterstützt, der zu einem vertrauenswürdigen Verbündeten wird. Allerdings werden Taros Eltern von der CIA entführt, mit Drogen behandelt und einer Gehirnwäsche unterzogen, sodass sie zu leeren Hüllen werden. Der verantwortliche CIA-Agent bereut später seine Taten und hilft Taro.

Dangar, der seinen eigenen Körper in einen Cyborg verwandelt hat, kehrt nach Japan zurück, um die finale Konfrontation zu suchen. In der Zwischenzeit wird John Kowalski von Taro und Judy beschützt. Johns Kräfte wachsen unter der Anleitung eines aus Indien geholten Yogi und Meisters der Psychokräfte. Die Erzählung entfaltet sich als Kampf zwischen den drei Eliten: Dangars Ehrgeiz nach planetarer und später kosmischer Herrschaft, Taros widerwilligem, aber entschlossenem Heldentum und Johns Rolle als Wesen reinen Potenzials. Die Geschichte berührt Themen der menschlichen Fähigkeit zur Selbstzerstörung und Erlösung, wobei die Eröffnungsszenen den Vietnamkrieg als Hintergrund erwähnen. Die Frage, ob die Menschheit sich selbst vernichten oder der Sterne würdig erweisen wird, liegt in den Händen der Eliten.