"THREE (Manga)" spielt in einer dystopischen Zukunft, in der die Menschheit durch eine mysteriöse Pandemie, bekannt als "Der Schrei", dezimiert wurde. Die Krankheit verwandelt Infizierte in aggressive, zombieähnliche Kreaturen, die als "Schreier" bezeichnet werden. Die Überlebenden leben in ständiger Angst vor Ansteckung und den Angriffen dieser Kreaturen. Die Handlung konzentriert sich auf drei Hauptfiguren: Kana, eine junge Frau mit einem geheimnisvollen Hintergrund, die über übernatürliche Fähigkeiten verfügt; Shuu, ein ehemaliger Soldat, der nach dem Verlust seiner Familie von Schuldgefühlen geplagt wird; und Akira, ein Wissenschaftler, der verzweifelt nach einem Heilmittel für die Pandemie sucht.

Die drei Protagonisten treffen unter widrigen Umständen aufeinander und schließen sich zusammen, um in einer Welt voller Chaos und Gefahren zu überleben. Kana spielt eine zentrale Rolle, da ihre Fähigkeiten möglicherweise der Schlüssel zur Bekämpfung der Pandemie sind. Shuu übernimmt die Rolle des Beschützers und kämpft gegen die Schreier, während Akira versucht, seine wissenschaftlichen Erkenntnisse zu nutzen, um eine Lösung zu finden. Ihre Reise führt sie durch verlassene Städte, überlebende Gemeinschaften und gefährliche Gebiete, in denen sie nicht nur den Schreiern, sondern auch anderen Überlebenden begegnen, die ihre eigenen Ziele verfolgen.

Im Laufe der Geschichte werden die Hintergründe der Charaktere und ihre Motivationen nach und nach enthüllt. Kana verbirgt ein dunkles Geheimnis, das mit der Entstehung der Pandemie zusammenhängt, während Shuu und Akira mit ihren eigenen inneren Konflikten und moralischen Dilemmata kämpfen. Die Handlung ist geprägt von Spannung, Action und emotionalen Momenten, während die Charaktere versuchen, in einer Welt zu überleben, die von Verzweiflung und Hoffnungslosigkeit geprägt ist. Die Serie untersucht Themen wie Überleben, Menschlichkeit und die moralischen Grenzen, die in Extremsituationen überschritten werden können.