"Imoten (Manga)" handelt von den Geschwistern Imoko und Tentaro, die in einer Welt leben, in der übernatürliche Phänomene und Geister alltäglich sind. Imoko, die ältere Schwester, besitzt die Fähigkeit, Geister zu sehen und mit ihnen zu interagieren, während Tentaro, ihr jüngerer Bruder, ein normales Leben führt, ohne von diesen Fähigkeiten zu wissen. Die Geschichte beginnt damit, dass Imoko versucht, ihr Geheimnis vor Tentaro zu bewahren, um ihn nicht zu beunruhigen oder in Gefahr zu bringen. Doch als Tentaro zufällig in einen Vorfall mit einem Geist verwickelt wird, kommt die Wahrheit ans Licht.

Im Laufe der Serie wird deutlich, dass Imokos Fähigkeiten nicht nur ein Fluch, sondern auch eine Verantwortung sind. Sie wird oft von Geistern um Hilfe gebeten, die unerledigte Angelegenheiten in der menschlichen Welt haben. Gleichzeitig muss sie sich mit bösartigen Geistern auseinandersetzen, die den Frieden der Lebenden bedrohen. Tentaro, der zunächst schockiert und verängstigt ist, beginnt allmählich, seine Schwester zu unterstützen, und entwickelt eine tiefe Bewunderung für ihren Mut und ihre Entschlossenheit.

Die Beziehung zwischen den Geschwistern steht im Mittelpunkt der Handlung. Während Imoko versucht, Tentaro zu beschützen, lernt Tentaro, seine Schwester zu verstehen und ihre Last zu teilen. Die Serie erkundet Themen wie familiäre Bindungen, Verantwortung und das Gleichgewicht zwischen der menschlichen und der geisterhaften Welt. Neben den übernatürlichen Elementen gibt es auch humorvolle und herzerwärmende Momente, die das tägliche Leben der Geschwister und ihre Interaktionen mit Freunden und Nachbarn zeigen.

Die Handlung entwickelt sich durch verschiedene Episoden, in denen Imoko und Tentaro unterschiedliche Geister und deren Geschichten kennenlernen. Jeder Geist hat eine einzigartige Hintergrundgeschichte, die oft mit unerfüllten Wünschen, Trauer oder Schuld verbunden ist. Diese Geschichten tragen dazu bei, die emotionale Tiefe der Serie zu verstärken und die Charakterentwicklung der Protagonisten voranzutreiben. Im Laufe der Zeit wird auch die Vergangenheit der Geschwister und die Herkunft von Imokos Fähigkeiten näher beleuchtet, was neue Konflikte und Herausforderungen mit sich bringt.