"Midnight Rain (Manga)" erzählt die Geschichte von Akira, einem jungen Mann, der in einer von Dunkelheit und Geheimnissen geprägten Stadt lebt. Akira arbeitet als Nachtwächter in einem verlassenen Krankenhaus, das für seine unheimliche Atmosphäre bekannt ist. Eines Nachts begegnet er einer mysteriösen Frau namens Yuki, die behauptet, eine Geisterjägerin zu sein. Yuki offenbart, dass das Krankenhaus ein Portal zu einer anderen Welt ist, in der verlorene Seelen gefangen sind. Gemeinsam beschließen sie, das Geheimnis des Krankenhauses zu lüften und die Seelen zu befreien.

Im Laufe der Handlung wird deutlich, dass Akira eine besondere Verbindung zu dieser anderen Welt hat. Er beginnt, Erinnerungen an eine vergangene Existenz zu erlangen, die eng mit dem Krankenhaus und den darin gefangenen Seelen verknüpft ist. Yuki, die selbst ein dunkles Geheimnis verbirgt, unterstützt ihn bei seiner Suche nach der Wahrheit. Die beiden stoßen auf verschiedene Geister und Dämonen, die ihre eigenen Geschichten und Motive haben, und müssen sich zahlreichen Herausforderungen stellen, um das Gleichgewicht zwischen den Welten wiederherzustellen.

Die Handlung entwickelt sich durch eine Reihe von Episoden, in denen Akira und Yuki verschiedene Geister konfrontieren und deren Geschichten aufdecken. Dabei wird die Vergangenheit des Krankenhauses und seine Rolle als Bindeglied zwischen den Welten immer deutlicher. Die Charaktere werden durch ihre Interaktionen und die Enthüllungen ihrer eigenen Hintergründe weiterentwickelt, was zu einer komplexen und emotional aufgeladenen Erzählung führt. "Midnight Rain" verbindet Elemente des Übernatürlichen, der Mystery und der Charakterstudie zu einer dichten und fesselnden Geschichte.