"Touge Oni: Primal Gods in Ancient Times" spielt in einer mythologisch geprägten Welt des antiken Japans und verbindet historische Elemente mit übernatürlichen Kräften. Die Handlung dreht sich um Miyo, ein junges Mädchen, das aufgrund ihrer ungewöhnlichen Fähigkeiten, mit Göttern zu kommunizieren, von ihrer Dorfgemeinschaft verstoßen wird. Miyo wird von einem wandernden Mönch namens Zen aufgenommen, der sie auf eine Reise durch eine von Gottheiten und Dämonen bevölkerte Welt führt. Zen ist ein mysteriöser und weiser Begleiter, der über tiefes Wissen über die alten Götter und die Natur der spirituellen Kräfte verfügt.

Im Laufe der Geschichte begegnen Miyo und Zen verschiedenen Kami (Gottheiten) und Yōkai (Dämonen), die sowohl Beschützer als auch Bedrohungen darstellen. Die Reise führt sie durch abgelegene Bergregionen, heilige Stätten und vergessene Tempel, während sie sich mit den Konflikten zwischen den menschlichen und göttlichen Welten auseinandersetzen. Miyo entwickelt sich dabei von einer verunsicherten Außenseiterin zu einer selbstbewussten Figur, die ihre einzigartige Gabe nutzt, um zwischen den Welten zu vermitteln.

Ein zentrales Thema der Handlung ist das fragile Gleichgewicht zwischen Mensch und Natur, das durch die Einmischung der Götter und Dämonen gestört wird. Die Charaktere müssen sich mit moralischen Dilemmata und den Konsequenzen ihrer Handlungen auseinandersetzen, während sie versuchen, die Harmonie wiederherzustellen. Die Beziehung zwischen Miyo und Zen wird durch ihre gemeinsamen Erfahrungen vertieft, wobei Zen als Mentor fungiert, der Miyo hilft, ihre Rolle in dieser komplexen Welt zu verstehen.

Die Erzählung ist geprägt von einer Mischung aus Action, spirituellen Themen und mythologischen Bezügen, die die reiche Kultur und Folklore des antiken Japans widerspiegeln. Die Handlung bleibt eng mit den mythologischen Wurzeln verbunden, während sie gleichzeitig eine eigenständige und fesselnde Geschichte erzählt.