"Haunted Bookstore - Gateway to a Parallel Universe" ist eine Manga-Serie, die in einer Welt spielt, in der die Grenzen zwischen der menschlichen und der übernatürlichen Sphäre verschwimmen. Die Handlung dreht sich um Kaori, ein junges Mädchen, das nach dem Tod ihrer Eltern bei ihrem Großvater, einem Buchhändler, aufwächst. Dieser Buchladen ist jedoch kein gewöhnlicher Ort, sondern ein Tor zu einer Parallelwelt, in der Geister, Dämonen und andere mystische Wesen existieren. Der Großvater, ein erfahrener Exorzist, betreibt den Laden nicht nur als Geschäft, sondern auch als eine Art Schutzzone, in der er gefährliche übernatürliche Kreaturen bannt und Bücher mit magischen Kräften aufbewahrt.

Kaori, die zunächst nichts von der wahren Natur des Buchladens weiß, entdeckt nach und nach die Geheimnisse ihrer Familie und ihre eigene Verbindung zur übernatürlichen Welt. Sie erfährt, dass sie über besondere Fähigkeiten verfügt, die sie in die Lage versetzen, mit Geistern zu kommunizieren und magische Bücher zu nutzen. Im Laufe der Serie wird Kaori in verschiedene Konflikte verwickelt, bei denen sie sowohl menschliche als auch übernatürliche Gegner bekämpfen muss. Dabei wird sie von einer Reihe von Verbündeten unterstützt, darunter ein mysteriöser Geist namens Shiba, der im Buchladen lebt und über umfangreiches Wissen über die Parallelwelt verfügt.

Die Handlung entwickelt sich durch eine Mischung aus episodischen Abenteuern und einem übergeordneten Plot, der die Hintergründe der Parallelwelt und die Rolle des Buchladens als Bindeglied zwischen den Welten beleuchtet. Dabei werden Themen wie Verlust, Identität und die Verantwortung gegenüber anderen Wesen behandelt. Die Serie kombiniert Elemente des Übernatürlichen, der Fantasy und des Mystery-Genres, wobei die Charakterentwicklung und die Beziehungen zwischen den Figuren im Mittelpunkt stehen.