"Black Clover" spielt in einer Welt, in der Magie allgegenwärtig ist und die Gesellschaft stark von magischen Fähigkeiten geprägt ist. Die Handlung dreht sich um Asta, einen jungen Mann, der in einem abgelegenen Dorf aufwächst und ohne magische Kräfte geboren wurde. Trotz dieser scheinbaren Schwäche träumt Asta davon, der mächtigste Magier des Königreichs, der sogenannte "Zauberkaiser", zu werden. Sein bester Freund und Rivale, Yuno, besitzt dagegen außergewöhnliche magische Talente und teilt denselben Traum. Beide erhalten im Laufe der Geschichte magische Grimoires, Bücher, die die magischen Fähigkeiten ihres Besitzers verstärken. Während Yuno ein seltenes vierblättriges Grimoire erhält, bekommt Asta ein mysteriöses fünftblättriges Grimoire, das ihm die Fähigkeit verleiht, Anti-Magie einzusetzen.

Nachdem sie ihre Grimoire erhalten, treten Asta und Yuno dem Orden der "Schwarzen Stiere" bzw. den "Goldenen Dämmerungen" bei, zwei von mehreren magischen Ritterorden, die das Königreich Clover beschützen. Asta sticht dabei durch seine Entschlossenheit und seinen unerschütterlichen Willen hervor, obwohl er keine konventionelle Magie beherrscht. Im Laufe der Geschichte wird deutlich, dass das Königreich Clover von internen Konflikten, Korruption und äußeren Bedrohungen geplagt wird. Asta und seine Verbündeten müssen sich gegen mächtige Feinde wie das "Auge der Mitternachtssonne", eine Gruppe von Magiern, die dunkle Magie nutzen, und später gegen die Dämonen aus der Unterwelt behaupten.

Die Handlung entwickelt sich durch zahlreiche Kämpfe, Intrigen und die Enthüllung von Geheimnissen über die wahre Natur der Magie und die Geschichte des Königreichs. Astas Anti-Magie erweist sich als entscheidend im Kampf gegen übermächtige Gegner, während Yuno seine eigenen Fähigkeiten weiterentwickelt, um Asta nicht zurückzulassen. Neben den beiden Protagonisten spielen auch die Mitglieder der Schwarzen Stiere eine wichtige Rolle, darunter die Anführerin Yami, die über einzigartige Fähigkeiten verfügt, und Noelle, eine Adlige mit unkontrollierbaren magischen Kräften, die sich im Laufe der Zeit zu einer starken Verbündeten entwickelt.

Die Geschichte thematisiert Themen wie Freundschaft, Durchhaltevermögen und die Überwindung von Vorurteilen, da Asta trotz seiner magischen Schwäche immer wieder beweist, dass Willenskraft und Entschlossenheit genauso wichtig sind wie angeborene Talente. Die Handlung wird durch eine Mischung aus actionreichen Kämpfen, emotionalen Momenten und humorvollen Szenen vorangetrieben, während gleichzeitig die Welt und ihre Bewohner immer weiter ausgebaut werden.