"Sample (Manga)" erzählt die Geschichte eines jungen Protagonisten, der in einer dystopischen Zukunft lebt, in der die Gesellschaft streng hierarchisch organisiert ist. Die Handlung beginnt in einer abgeschotteten Stadt, in der die Bewohner in verschiedene Klassen unterteilt sind, die ihre Rechte und Pflichten bestimmen. Der Protagonist, ein Mitglied der untersten Klasse, entdeckt durch Zufall ein geheimes Labor, in dem Experimente an Menschen durchgeführt werden. Diese Experimente zielen darauf ab, die perfekte "Probe" zu schaffen, eine Person, die alle positiven Eigenschaften der menschlichen Spezies vereint.

Im Laufe der Geschichte wird der Protagonist in eine Widerstandsbewegung hineingezogen, die gegen das korrupte Regime kämpft. Dabei trifft er auf verschiedene Charaktere, darunter einen mysteriösen Wissenschaftler, der die Experimente leitet, und eine Gruppe von Rebellen, die versuchen, die Wahrheit über die Regierung aufzudecken. Die Handlung entwickelt sich durch eine Reihe von Konflikten und Enthüllungen, die die moralischen und ethischen Fragen der Experimente sowie die Auswirkungen der gesellschaftlichen Hierarchie auf die Individuen beleuchten.

Die Charaktere sind vielschichtig und zeigen unterschiedliche Motivationen und Hintergründe. Der Protagonist wird von einem naiven Jugendlichen zu einem entscheidenden Akteur im Kampf gegen das System. Der Wissenschaftler, der zunächst als Antagonist erscheint, enthüllt im Laufe der Geschichte seine eigenen moralischen Dilemmata und Beweggründe. Die Rebellen bieten eine Vielfalt an Persönlichkeiten, die die verschiedenen Facetten des Widerstands darstellen.

Die Handlung ist geprägt von Spannung, politischen Intrigen und philosophischen Fragen über die Natur der Menschheit und die Grenzen der Wissenschaft. Die Geschichte endet mit einem offenen Finale, das Raum für Interpretationen lässt und die Leser dazu anregt, über die Konsequenzen der dargestellten Ereignisse nachzudenken.