"To Terra" ist eine Science-Fiction-Manga-Serie, die in einer fernen Zukunft spielt, in der die Menschheit auf einer übertechnologisierten Erde lebt. Die Gesellschaft wird von einem Supercomputer namens "Mutter" kontrolliert, der das Leben der Menschen regelt und eine utopische, aber streng kontrollierte Ordnung aufrechterhält. Kinder werden genetisch ausgewählt und in speziellen Einrichtungen erzogen, um ihre Fähigkeiten zu maximieren. Jene, die als "Mu" bezeichnet werden, sind Mutanten mit übernatürlichen Kräften, die von der Gesellschaft als Bedrohung angesehen und verfolgt werden.

Die Handlung konzentriert sich auf Jomy Marcus Shin, einen jungen Mann, der in der von "Mutter" dominierten Gesellschaft aufwächst. Als er sich einer Prüfung unterzieht, um seinen Platz in der Gesellschaft zu sichern, entdeckt er, dass er ein Mu ist. Er wird von den Mu gerettet, die außerhalb der menschlichen Zivilisation leben und von ihrem Anführer, Soldier Blue, geführt werden. Jomy schließt sich den Mu an und erfährt, dass sie eine Rückkehr zu ihrem Heimatplaneten Terra anstreben, einem Ort, der als ihre wahre Heimat gilt.

Während Jomy seine Kräfte entwickelt und sich an seine neue Rolle als Anführer der Mu gewöhnt, wird die Spannung zwischen den Mu und der menschlichen Gesellschaft immer größer. Die Menschen, angeführt von der strengen Organisation "Supreme Council", sehen die Mu als Bedrohung für ihre perfekte Weltordnung und versuchen, sie zu vernichten. Gleichzeitig gibt es innerhalb der Mu-Fraktion Konflikte über den richtigen Weg, um ihre Ziele zu erreichen, insbesondere zwischen Jomy und Soldier Blue, der einen radikaleren Ansatz verfolgt.

Die Geschichte erforscht Themen wie Identität, Freiheit und die Konsequenzen von technologischem Fortschritt. Sie zeigt die moralischen Dilemmata, mit denen beide Seiten konfrontiert sind, und die komplexen Beziehungen zwischen den Charakteren. Die Handlung entwickelt sich zu einem epischen Konflikt, der die Zukunft der Menschheit und der Mu entscheidet, während Jomy versucht, eine Brücke zwischen den beiden Welten zu schlagen und eine Lösung zu finden, die sowohl für die Mu als auch für die Menschen akzeptabel ist.