"World’s End Harem" ist eine Manga-Serie, die in einer dystopischen Zukunft spielt, in der ein tödliches Virus namens MK-Virus die männliche Bevölkerung fast vollständig ausgelöscht hat. Nur fünf Männer weltweit sind immun gegen das Virus und überleben. Der Protagonist, Reito Mizuhara, ist einer dieser fünf Männer. Er wird in eine spezielle Einrichtung gebracht, wo er als "Reproduktionskandidat" fungiert, um die Menschheit vor dem Aussterben zu bewahren. Reito befindet sich jedoch in einem künstlichen Koma, während die anderen vier Männer bereits aktiv an der Reproduktion beteiligt sind.

Die Handlung beginnt, als Reito nach drei Jahren aus dem Koma erwacht. Er erfährt, dass die Welt, wie er sie kannte, nicht mehr existiert und dass Frauen nun die dominierende Kraft in der Gesellschaft sind. Reito wird mit der Aufgabe konfrontiert, sich mit verschiedenen Frauen zu paaren, um die menschliche Population wiederherzustellen. Allerdings hat er ein persönliches Ziel: Er möchte seine Jugendliebe, Erisa Tachibana, finden, die vor seinem Koma verschwunden ist. Diese Suche wird zu einem zentralen Motiv der Geschichte.

Während Reito versucht, Erisa zu finden, wird er in politische und ethische Konflikte verwickelt. Die Regierung und verschiedene Organisationen haben unterschiedliche Interessen an den überlebenden Männern, was zu Machtkämpfen und Manipulationen führt. Reito muss sich nicht nur mit den Erwartungen der Gesellschaft auseinandersetzen, sondern auch mit den moralischen Dilemmata, die seine Rolle als einer der letzten Männer mit sich bringt.

Neben Reito spielen auch die anderen überlebenden Männer eine Rolle in der Handlung. Jeder von ihnen hat eine eigene Persönlichkeit und Motivation, die sich in ihren Handlungen widerspiegelt. Die Serie untersucht die Auswirkungen des MK-Virus auf die Gesellschaft, die Geschlechterdynamik und die menschliche Natur im Allgemeinen. Dabei werden Themen wie Macht, Kontrolle, Sexualität und Ethik behandelt.

Die Handlung ist geprägt von Spannung, politischen Intrigen und emotionalen Konflikten. Die Charaktere entwickeln sich im Laufe der Geschichte weiter, und ihre Beziehungen zueinander werden komplexer. "World’s End Harem" bietet eine Mischung aus Science-Fiction, Drama und erotischen Elementen, die in einer dystopischen Welt angesiedelt sind.