"Blue, Blue, Atopos" ist eine Manga-Serie, die in einer dystopischen Zukunft spielt, in der die Menschheit durch eine mysteriöse Krankheit bedroht wird. Die Krankheit, bekannt als "Atopos", führt dazu, dass die Betroffenen ihre Emotionen verlieren und schließlich in einen vegetativen Zustand verfallen. Die Handlung konzentriert sich auf die Protagonistin Aoi, eine junge Wissenschaftlerin, die verzweifelt nach einem Heilmittel sucht, um ihren jüngeren Bruder zu retten, der bereits von der Krankheit befallen ist.

Aoi schließt sich einer Gruppe von Überlebenden an, die in den Ruinen einer verlassenen Stadt leben. Diese Gruppe wird von einem charismatischen Anführer namens Ren geleitet, der selbst ein Überlebender der Krankheit ist und über ungewöhnliche Fähigkeiten verfügt. Zusammen erkunden sie die gefährliche Außenwelt, um Ressourcen und Informationen zu sammeln, die bei der Entwicklung eines Heilmittels helfen könnten. Dabei stoßen sie auf feindliche Fraktionen, die ebenfalls um das Überleben kämpfen, sowie auf geheimnisvolle Organisationen, die möglicherweise mehr über die Ursprünge von Atopos wissen.

Im Verlauf der Geschichte werden die komplexen Beziehungen zwischen den Charakteren beleuchtet, insbesondere die wachsende Bindung zwischen Aoi und Ren. Aoi muss nicht nur mit den physischen Gefahren der Außenwelt fertig werden, sondern auch mit ihren eigenen inneren Konflikten und der moralischen Fragwürdigkeit ihrer Forschung. Die Serie thematisiert Fragen nach Identität, Menschlichkeit und den Preis des Überlebens in einer Welt, die am Rande des Zusammenbruchs steht.

Die Handlung ist geprägt von unerwarteten Wendungen und Enthüllungen, die die Motivationen der Charaktere und die wahre Natur der Krankheit in Frage stellen. Die Serie kombiniert Elemente von Science-Fiction, Drama und Thriller, um eine dichte und fesselnde Erzählung zu schaffen, die den Leser bis zum Ende in Atem hält.