"Star Ocean: Till the End of Time (Manga)" ist eine Adaption des gleichnamigen Rollenspiels und spielt in einem Science-Fiction-Universum, das Raumfahrt, fremde Planeten und fortgeschrittene Technologie miteinander verbindet. Die Handlung beginnt mit Fayt Leingod, einem jungen Mann, der mit seiner Familie und seiner Freundin Sophia Esteed auf dem Resort-Planeten Hyda IV Urlaub macht. Während ihres Aufenthalts wird der Planet plötzlich von einer mysteriösen Alien-Rasse namens Vendeeni angegriffen. Fayt und Sophia werden getrennt, und Fayt findet sich auf dem unterentwickelten Planeten Vanguard III wieder, wo er auf die Einheimische Nel Zelpher trifft. Zusammen versuchen sie, einen Weg zurück in die Zivilisation zu finden und Sophia zu retten.

Im Laufe der Geschichte wird deutlich, dass Fayt eine Schlüsselrolle in einem größeren Konflikt spielt. Seine genetischen Fähigkeiten, die als "Symbologie" bezeichnet werden, machen ihn zu einem Ziel für die Vendeeni und andere mächtige Organisationen. Die Handlung vertieft sich in die Beziehungen zwischen den Charakteren, insbesondere Fayts Freundschaft mit Nel und seiner Verbindung zu Sophia. Es wird auch aufgedeckt, dass die Vendeeni Teil eines noch größeren Geheimnisses sind, das die wahre Natur des Universums betrifft.

Die Reise führt die Charaktere durch verschiedene Planeten und Dimensionen, wobei sie auf eine Vielzahl von Verbündeten und Feinden treffen, darunter Cliff Fittir, ein charismatischer Rebell, und Maria Traydor, eine geheimnisvolle Frau mit eigenen verborgenen Motiven. Die Handlung erforscht Themen wie Identität, Schicksal und die Grenzen der menschlichen Wahrnehmung, während die Charaktere mit der Enthüllung konfrontiert werden, dass ihre Realität möglicherweise nicht das ist, was sie zu sein scheint.

Der Manga bleibt eng an der Vorlage des Spiels und bietet eine detaillierte Darstellung der Charaktere und ihrer Entwicklung. Die Handlung ist reich an Action, emotionalen Momenten und philosophischen Untertönen, die die Komplexität des Universums von "Star Ocean" widerspiegeln.