"Magic Tree House" (Film) erzählt die Geschichte der Geschwister Jack und Annie, die in einem kleinen Dorf leben und eines Tages auf ein geheimnisvolles Baumhaus im Wald stoßen. Das Baumhaus entpuppt sich als magisches Portal, das sie in verschiedene Epochen und Orte der Weltgeschichte transportieren kann. Durch das Aufschlagen eines Buches im Baumhaus können die beiden Kinder in die Vergangenheit reisen und dort Abenteuer erleben, während sie gleichzeitig wichtige historische Ereignisse und Persönlichkeiten kennenlernen.

Ihre erste Reise führt Jack und Annie in die Zeit der Dinosaurier, wo sie nicht nur prähistorische Kreaturen entdecken, sondern auch lernen, wie man in einer gefährlichen Umgebung überlebt. Dabei müssen sie Rätsel lösen und Aufgaben erfüllen, um sicher nach Hause zurückzukehren. Im Laufe des Films besuchen sie weitere historische Schauplätze, darunter das alte Ägypten, das mittelalterliche Europa und das antike Japan. Jede Reise stellt sie vor neue Herausforderungen, die sowohl ihren Mut als auch ihre Intelligenz auf die Probe stellen.

Jack, der ältere und vorsichtigere der beiden, ist oft derjenige, der die Situationen analysiert und logische Lösungen findet. Annie hingegen ist abenteuerlustig und impulsiv, was manchmal zu unerwarteten Wendungen führt. Trotz ihrer unterschiedlichen Persönlichkeiten ergänzen sie sich gut und arbeiten zusammen, um die Aufgaben zu bewältigen, die ihnen das Baumhaus stellt.

Ein wiederkehrendes Element ist die mysteriöse Besitzerin des Baumhauses, Morgan le Fay, eine Zauberin, die den Kindern Hinweise und Ratschläge gibt, um sie auf ihren Reisen zu unterstützen. Ihre Rolle bleibt zunächst rätselhaft, doch im Laufe des Films wird deutlich, dass sie eine Schlüsselfigur in der magischen Welt des Baumhauses ist.

Der Film verbindet historische Fakten mit fantastischen Elementen und schafft so eine lehrreiche und unterhaltsame Geschichte. Die Reisen von Jack und Annie vermitteln nicht nur Wissen über verschiedene Kulturen und Epochen, sondern betonen auch Werte wie Teamwork, Mut und Neugier. Die Handlung ist linear aufgebaut, wobei jede Reise eine in sich abgeschlossene Episode darstellt, die jedoch in einen größeren narrativen Rahmen eingebettet ist.