In den belebten Straßen von Shinjuku, Tokio, führt eine junge Attentäterin, die nur als Glass Heart bekannt ist, ihren letzten Auftrag aus. Von Kindheit an von einer zwielichtigen Unterweltorganisation ausgebildet, wurde sie darauf konditioniert, emotionslos zu töten, doch das Gewicht ihrer Taten wird unerträglich. Sie versucht Selbstmord, indem sie von einem Gebäude springt, überlebt aber nur dank einer Notfall-Herztransplantation. Die Spenderin ist Kaori Makimura, eine lebensfrohe und warmherzige junge Frau, die kürzlich bei einem Verkehrsunfall ums Leben kam. Dem medizinischen Personal ist nicht bekannt, dass Kaori die langjährige Partnerin von Ryo Saeba war, einem legendären Privatdetektiv und „Sweeper“, der gefährliche Fälle in der ganzen Stadt übernimmt und aus einem heruntergekommenen Büro mit einem „XYZ“-Anrufbeantworter für hilfesuchende Klienten operiert.

Nach ihrer Genesung verlässt Glass Heart ihre Vergangenheit und spürt Ryo auf, getrieben von fremden Gefühlen und fragmentierten Erinnerungen, die Kaori zu gehören scheinen. Sie nimmt den Namen Xiang Ying an und wird, trotz Ryos anfänglichem Widerstand, seine neue Partnerin. Gemeinsam arbeiten sie als nicht lizenzierte Problemlöser, bearbeiten alles von Erpressung und Entführung bis zu Mordermittlungen und geraten dabei oft mit der organisierten Kriminalität und korrupten Beamten aneinander. Im Laufe der Serie kämpft Xiang Ying damit, ihre tödliche Ausbildung mit Kaoris sanftem Herzen in Einklang zu bringen, das zunehmend ihre Entscheidungen beeinflusst. Sie empfindet Geschmäcker, Ängste und Bindungen, die nicht ihre eigenen sind, darunter einen tiefen Beschützerinstinkt gegenüber Ryo und eine anhaltende Trauer über Kaoris unvollendetes Leben.

Ryo indes verdeckt seine Trauer weiterhin mit übermütigem Charme, Kettenrauchen und der Angewohnheit, mit jeder Frau zu flirten, die er trifft, doch er akzeptiert Xiang Ying stillschweigend als eine zweite Chance, Kaoris Andenken zu ehren. Ihre Partnerschaft wird durch wiederkehrende Bedrohungen des Syndikats, das Glass Heart erschuf, auf die Probe gestellt, das sie zurückhaben oder ausschalten will. Ein größerer Handlungsbogen folgt der Jagd auf ihren früheren Führungsoffizier, einen skrupellosen Agenten, der als der Professor bekannt ist und der ihr eine Notfall-Giftkapsel implantiert hat, die noch immer in ihrem Körper schlummert. Ein weiterer ausgedehnter Bogen dreht sich um ein mysteriöses junges Mädchen, das behauptet, Kaoris uneheliche Tochter zu sein, was Ryo und Xiang Ying zwingt, Kaoris verborgene Vergangenheit zu untersuchen und das Kind vor Menschenhändlern zu schützen.

Zu den Nebenfiguren gehören der tollpatschige aber gutmütige Polizeidetektiv Hideaki Todo, der oft über Ryos Fälle stolpert; Miki, eine straßenschlaue Informantin und Besitzerin einer katzenbezogenen Bar; und ein pensionierter Attentäter, der widerwillig zum Verbündeten wird. Im Verlauf der Serie lernt Xiang Ying allmählich, sowohl ihre eigene Identität als auch Kaoris fortbestehende Präsenz anzunehmen, und erkennt, dass ihre zweite Chance im Leben bedeutet, diejenigen zu beschützen, die Kaori liebte. Die Staffel gipfelt in einer finalen Konfrontation mit dem Professor, bei der Xiang Ying zwischen ihren programmierten Instinkten und der in ihr wachsenden Menschlichkeit wählen muss. Ryo, der an ihrer Seite steht, erkennt schließlich an, dass Kaoris Herz seinen Weg nach Hause gefunden hat.