Shouichi Tsugami trifft auf seinen alten Freund und früheren Betreuer, Dr. Higashi Kunieda, der ihn während seines Krankenhausaufenthalts wegen Amnesie versorgte. Als sie sich nach einem Jahr Trennung wieder verbinden, spürt Shouichi die Anwesenheit eines Unknown und eilt los, um zu kämpfen. Er verwandelt sich in Agito Burning Form, doch nachdem die Kreatur flieht, verliert Shouichi die Kontrolle über seine Kräfte und greift Dr. Kunieda gewaltsam an, der ihm gefolgt war und die Verwandlung beobachtet hatte. Der Doktor schafft es, Shouichi zu beruhigen, aber der junge Mann erschrickt vor seinen eigenen außer Kontrolle geratenen Fähigkeiten und rennt davon.

Dr. Kunieda holt Shouichi ein und teilt eine schmerzhafte Wahrheit mit: Sein eigener Sohn hat sich vor sechs Monaten das Leben genommen, weil er seine langsame, schmerzhafte Verwandlung in Agito nicht ertragen konnte. Der Doktor drängt Shouichi, die Hoffnung nicht aufzugeben, und versichert ihm, dass sich der Himmel schließlich aufklären wird. Als Shouichi erneut den Unknown spürt, kehrt er mit neuem Selbstvertrauen in den Kampf zurück. Alle drei Rider – Agito, G3 und Gills – vereinen ihre Kräfte gegen den mächtigen Beetle Lord, doch selbst ihre vereinte Stärke reicht nicht aus, um ihn zu besiegen. Als Agito Burning Form nach oben blickt, sieht er einen klaren blauen Himmel, nutzt die Kraft der Sonne und transzendiert zu Agito Shining Form, der den Beetle Lord im Alleingang zerstört. Der Special endet damit, dass ein mysteriöses Mädchen den G-Anhänger infiltriert und das G4-Projekt ausspioniert, was Ereignisse vorbereitet, die im Film Kamen Rider Agito: Project G4 fortgesetzt werden. Dieser Fernsehspecial, der zwischen den Episoden 35 und 36 der Serie ausgestrahlt wurde, markiert auch die ersten Auftritte von G3 Mild und Agito Shining Form.