Yui Kazama, die aktuelle Sukeban Deka, findet sich in den Diensten einer neuen Regierungsinitiative namens Jugend-Sicherheitsbehörde wieder. Diese Eliteorganisation, angeführt vom charismatischen aber skrupellosen Politiker Kuraudo Sekine, wurde geschaffen, um mit extremer Härte gegen die eskalierende Jugendkriminalität vorzugehen. Sekine hat seine jungen Agenten mit tödlichen Dreiklingen-Yo-Yos ausgestattet und sanktioniert brutale Taktiken, inklusive standrechtlicher Hinrichtungen. Unbehaglich angesichts der zunehmend fanatischen und gewalttätigen Methoden der Behörde weigert sich Yui, an einer Undercover-Mission teilzunehmen, und tritt offiziell zurück, in der Hoffnung, mit ihren älteren Schwestern Yuka und Yuma ein normales Leben zu führen.

Ihr Ruhestand währt nur kurz. Yui entdeckt, dass Sekine und die Jugend-Sicherheitsbehörde nicht nur übereifrig sind, sondern grundlegend korrupt. Die Behörde hat eine Reihe von Terroranschlägen inszeniert und eine unschuldige Bande jugendlicher Straftäter, bekannt als die Outcast League, dafür verantwortlich gemacht. Als die Kazama-Schwestern tiefer graben, enthüllen sie die schockierende Wahrheit: Sekines ultimatives Ziel ist es, mit seiner Privatarmee aus Schüler-Agenten die japanische Regierung in einem gewaltsamen Staatsstreich zu stürzen.

Zum Handeln gezwungen, erkennt Yui, dass sie Sekines Verschwörung nicht alleine stoppen kann. Sie und ihre Schwestern, jede mit ihrer eigenen einzigartigen unkonventionellen Waffe, bilden ein fragiles Bündnis mit genau den Außenseitern, die die Behörde zu beseitigen versucht. Gemeinsam mit dem desillusionierten Anführer der Outcasts, Kei, werden die Kazama-Schwestern zur letzten Verteidigungslinie. Sie starten einen verzweifelten Gegenangriff gegen die korrupte Behörde und liefern sich einen hochriskanten Kampf zu Lande, zu Wasser und in der Luft, um die Verschwörung aufzudecken und Japan vor dem Absturz in die Tyrannei zu bewahren.