Ein legendärer Auftragskiller, der noch nie einen Job vermasselt hat, Juzo Ogami, hat sein Erwachsenenleben als tödlichster Operativer des Z.O.O.-Syndikats verbracht. Während einer Mission, um Kriminelle zu eliminieren, die mit der Genmanipulationsfirma Mitsuoka Pharmaceuticals in Verbindung stehen, wird er von einer mysteriösen Wespe gestochen, die seine DNA umschreibt und seinen Körper auf den eines dreizehnjährigen Jungen zurückbildet. Unfähig, in seiner neuen Form als Attentäter zu arbeiten, gibt ihm sein Chef einen seltsamen neuen Auftrag: sich an einer privaten Mittelschule einzuschreiben, um deren Sicherheit für die Tochter des Chefs zu bewerten.

Trotz eines Lebens voller Gewalt und ohne formale Bildung entdeckt Ogami schnell eine echte Liebe zum Mittelschulleben. Er muss nun das Chaos von Klassenzimmern, Freundschaften und außerschulischen Aktivitäten mit seiner laufenden Attentäterarbeit in Einklang bringen, während er seine wahre Identität vor seinen Mitschülern verbirgt. Seine Situation wird noch komplizierter, als er Noren Mitsuoka trifft, die Erbin des Pharmaunternehmens, das die Wespe erschaffen hat, die ihn verwandelte. Noren könnte den Schlüssel zur Umkehrung seines Zustands besitzen, aber die Verbindungen ihrer Familie zu gefährlichen Genexperimenten zwingen Ogami, sich durch ein Netz aus Unternehmensverschwörung und Schulhofdrama zu navigieren.

Gemeinsam mit Mitschülern wie dem scharfsinnigen Tenma Tendo, der sportlichen Chisato Shiraishi und dem exzentrischen Kotatsu Nekota erlebt Ogami jugendliche Meilensteine, die er nie hatte – von Futsal-Turnieren und Zwischenprüfungen bis zu Schulfesten und aufkeimenden Freundschaften. Jeder Tag zieht ihn tiefer in die gewöhnlichen Freuden der Adoleszenz, selbst während rivalisierende Attentäter, Unternehmensagenten und die Forderungen des Syndikats drohen, ihn zurück in die Schatten zu ziehen. Die zentralen Handlungsbögen folgen seinem Kampf, sein neues Leben zu schützen, während er nach einem Heilmittel sucht, und echte Bindungen zu knüpfen, die ihn den Weg, den er jahrzehntelang gegangen ist, infrage stellen lassen. Während die Geheimnisse von Mitsuoka Pharmaceuticals enthüllt werden, muss Ogami entscheiden, wie viel von seinem alten Selbst er bereit ist, zurückzulassen.