Eine dicke Wolkenschicht hüllt den Planeten seit hundert Jahren ein und blockiert alles Sonnenlicht. Pflanzen sind verwelkt, und der Sauerstoffgehalt der Atmosphäre ist gefährlich niedrig. Um zu überleben, entwickelte die Menschheit die Transfloration, eine Technologie, die Menschen in Pflanzen verwandelt. Der Prozess ist offiziell für unheilbar Kranke reserviert, doch die Teilnehmer erhalten eine hohe Geldprämie für die zwei Jahre, die die Verwandlung dauert. Dies schafft eine klare Wahl: entweder als Mensch in einer trostlosen Welt weiterzuleben oder ein neues Leben als Pflanze zu beginnen.

Toshiro Kamiya sieht keine Zukunft in seiner menschlichen Existenz. Er träumte einst davon, Musiker zu werden, doch seine schlechten Noten und die Notwendigkeit, die Medikamente seiner kranken Mutter zu bezahlen, haben seine Hoffnungen zerstört. Nachdem seine Mutter seine Ersparnisse stiehlt, beschließt er, sich der Transfloration zu unterziehen. Seine Kindheitsfreundin Yomiko Horai, die in einer Transflorationsklinik arbeitet, führt den Eingriff durch. Während der Verwandlung erlangt Toshiro unerwartet die Fähigkeit, die Sprache der Pflanzen zu verstehen. Seine Mutter nimmt erneut sein Geld, sodass er mittellos dasteht, und er nutzt seine neue Kraft, um Arbeit zu finden: Er sucht im Auftrag von Familien nach verwandelten Pflanzen und kommuniziert mit ihnen.

Die Geschichte folgt Toshiro, während er sich in dieser seltsamen Rolle zurechtfindet und die verborgenen Wahrheiten hinter der Transfloration und der Gesellschaft, die von ihr abhängt, aufdeckt. Konflikte entstehen mit einer gewalttätigen Pflanzenkreatur namens Ivy, und Toshiros Beteiligung an einer Gruppe von Rebellen sowie die fragwürdigen Praktiken von Transflora Medical zwingen ihn, die Ethik des gesamten Systems zu hinterfragen. Die Handlungsbögen erkunden persönliche Opfer, wirtschaftliche Verzweiflung, die Grenze zwischen Mensch und Pflanze sowie die moralischen Kosten einer Technologie, die ein Leben gegen ein anderes eintauscht.