Die Anime-Serie "Amnesia" basiert auf einem visuellen Roman und erzählt die Geschichte einer jungen Frau, die eines Morgens ohne Erinnerungen an ihre Vergangenheit erwacht. Sie wird von einem mysteriösen Geist namens Orion begleitet, der sich in ihrem Bewusstsein befindet und versucht, ihr zu helfen, ihre Identität und ihre verlorenen Erinnerungen wiederzufinden. Die Protagonistin, deren Name unbekannt bleibt, findet sich in einer fremden Umgebung wieder und muss herausfinden, wer sie ist und welche Beziehungen sie zu den Menschen in ihrem Leben hat.

Die Handlung entfaltet sich in einer alternativen Welt, die von einer Mischung aus modernen und historischen Elementen geprägt ist. Die Protagonistin trifft auf mehrere männliche Charaktere, die alle eine enge Verbindung zu ihr zu haben scheinen: Shin, Ikki, Kent, Toma und Ukyo. Jeder dieser Charaktere repräsentiert eine mögliche Liebesgeschichte, und die Handlung verzweigt sich in verschiedene Routen, die auf den Entscheidungen der Protagonistin basieren. Jede Route enthüllt unterschiedliche Aspekte ihrer Vergangenheit und ihrer Beziehungen, während sie gleichzeitig versucht, die Ursache für ihren Gedächtnisverlust zu verstehen.

Shin ist ein junger Mann, der als ihr Freund vorgestellt wird, aber ihre Beziehung ist von Spannungen und Missverständnissen geprägt. Ikki ist ein charismatischer und beliebter Mann, der von vielen Frauen umschwärmt wird, aber eine tiefere Verbindung zur Protagonistin hat. Kent ist ein rationaler und analytischer Charakter, der oft distanziert wirkt, aber eine sanfte Seite zeigt. Toma ist ein enger Freund, der überfürsorglich und beschützend ist, was jedoch manchmal in Besessenheit umschlägt. Ukyo ist ein rätselhafter Charakter, dessen Rolle und Absichten zunächst undurchsichtig bleiben.

Im Laufe der Serie wird deutlich, dass der Gedächtnisverlust der Protagonistin mit einem mysteriösen Ereignis zusammenhängt, das ihre Existenz bedroht. Orion, der Geist, spielt eine Schlüsselrolle bei der Aufklärung dieses Rätsels, indem er die Protagonistin durch ihre Erinnerungen führt und ihr Hinweise gibt. Die Handlung ist geprägt von Momenten der Spannung, Romantik und emotionaler Tiefe, während die Protagonistin versucht, ihre Identität wiederzuerlangen und ihre Beziehungen zu den Charakteren zu klären.

Die Serie kombiniert Elemente des Mystery-Genres mit romantischen und dramatischen Aspekten, wobei die Beziehungen zwischen den Charakteren im Mittelpunkt stehen. Die Handlung ist in mehrere Episoden unterteilt, die jeweils eine der möglichen Routen erkunden und so ein vielschichtiges Bild der Geschichte und der Charaktere zeichnen.