"Lights of the Clione" ist eine Anime-Serie, die sich um die Geschichte dreht, wie drei junge Mädchen – Akari, Rina und Yukari – versuchen, ihre Freundschaft und ihre Träume in einer Welt zu bewahren, die von einer mysteriösen Krankheit bedroht wird. Die Handlung spielt in einer nahen Zukunft, in der eine Pandemie namens "Clione" die Menschheit heimsucht. Diese Krankheit führt dazu, dass die Betroffenen langsam ihre Erinnerungen verlieren und schließlich in einen Zustand der Apathie verfallen. Die drei Protagonistinnen, die in einer abgelegenen Stadt leben, sind eng miteinander verbunden und teilen den Wunsch, eines Tages gemeinsam das Meer zu sehen, das sie noch nie zuvor erlebt haben.

Akari ist die optimistische und energische Anführerin der Gruppe, die stets versucht, ihre Freundinnen zu motivieren und die Hoffnung aufrechtzuerhalten. Rina, die ruhigere und nachdenklichere der drei, unterstützt Akari oft mit ihrer praktischen Denkweise und ihrem Einfallsreichtum. Yukari, die jüngste und emotionalste, kämpft mit den Auswirkungen der Krankheit, da ihre Mutter bereits von Clione betroffen ist. Die Serie zeigt, wie die Mädchen trotz der Bedrohung durch die Krankheit und der zunehmenden Isolation ihrer Stadt versuchen, ihre Träume zu verwirklichen und ihre Freundschaft zu stärken.

Im Laufe der Serie wird die Beziehung der Mädchen zueinander und zu ihrer Umgebung vertieft. Sie begegnen verschiedenen Herausforderungen, darunter die zunehmende Bedrohung durch die Krankheit, die Einschränkungen durch die Quarantäne und die emotionalen Belastungen, die mit dem Verlust von Erinnerungen einhergehen. Die Serie thematisiert dabei auch die Bedeutung von Hoffnung, Zusammenhalt und dem Festhalten an Träumen in einer unsicheren Welt. Die Handlung entwickelt sich langsam, wobei der Fokus auf den emotionalen Momenten und den Beziehungen zwischen den Charakteren liegt, während die Bedrohung durch Clione im Hintergrund stets präsent bleibt.