"Precure Miracle Universe" ist ein Anime-Film, der die bekannten Heldinnen der "Pretty Cure"-Reihe zusammenbringt. Die Handlung beginnt mit einem mysteriösen Vorfall im Weltraum, bei dem ein mächtiger Kristall, der sogenannte "Miracle Light", gestohlen wird. Dieser Kristall ist die Quelle der Energie, die das Gleichgewicht des Universums aufrechterhält. Ohne ihn droht das Universum in Chaos zu versinken. Die Precure-Heldinnen aus verschiedenen Serien, darunter Hana Nono (Cure Yell) aus "Hugtto! Precure", Mirai Asahina (Cure Miracle) aus "Mahou Tsukai Precure!" und andere, werden zusammengerufen, um den Kristall zurückzuholen und das Universum zu retten.

Die Heldinnen reisen in den Weltraum, wo sie auf eine Gruppe von Außerirdischen treffen, die den Diebstahl des Miracle Light zu verantworten haben. Diese Gruppe, angeführt von einem mysteriösen Anführer, hat ihre eigenen Gründe für den Diebstahl, die im Laufe der Geschichte enthüllt werden. Die Precure müssen nicht nur gegen diese Antagonisten kämpfen, sondern auch ihre eigenen Kräfte und Fähigkeiten kombinieren, um den Miracle Light zurückzuerobern. Dabei werden sie von neuen Verbündeten unterstützt, darunter ein junges Mädchen namens Lala Hagoromo, das eine besondere Verbindung zum Miracle Light hat.

Der Film kombiniert Action, Emotionen und humorvolle Momente, während die Heldinnen ihre Teamarbeit und Entschlossenheit unter Beweis stellen. Die Handlung betont die Bedeutung von Freundschaft, Zusammenarbeit und dem Glauben an sich selbst, um selbst die größten Herausforderungen zu bewältigen. Am Ende gelingt es den Precure, den Miracle Light zurückzugewinnen und das Universum vor der Zerstörung zu bewahren, wobei sie auch die Antagonisten dazu bringen, ihre wahren Absichten zu überdenken. Der Film endet mit einem Gefühl der Hoffnung und der Bestätigung, dass die Kraft des Guten immer siegen kann.