"Bats and Terry" ist ein Anime-Film, der in einer dystopischen Zukunft spielt, in der die Gesellschaft von korrupten Machthabern und kriminellen Organisationen beherrscht wird. Die Handlung dreht sich um zwei Protagonisten: Bats, einen ehemaligen Polizisten, der nach dem Verlust seiner Familie zu einem einsamen Vigilanten geworden ist, und Terry, einen jungen, aber erfahrenen Dieb, der sich auf das Stehlen von Technologie spezialisiert hat. Die beiden Charaktere treffen zufällig aufeinander, als Terry bei einem Raubzug in ein geheimes Labor stolpert, in dem Bats gerade eine gefährliche Verschwörung aufdeckt.

Das Labor gehört zu einer mächtigen Organisation, die illegale Experimente an Menschen durchführt, um eine überlegene Rasse von Supersoldaten zu erschaffen. Terry stiehlt versehentlich ein wichtiges Artefakt, das für die Experimente entscheidend ist, und wird daraufhin von der Organisation gejagt. Bats, der bereits seit Jahren im Untergrund gegen die Organisation kämpft, sieht in Terry eine Chance, die Pläne der Organisation endgültig zu zerstören. Obwohl sie zunächst unterschiedliche Ziele verfolgen, schließen sie sich zusammen, um gegen die gemeinsame Bedrohung vorzugehen.

Im Laufe der Geschichte enthüllt sich, dass die Organisation nicht nur militärische, sondern auch politische Kontrolle über die Gesellschaft ausübt. Die beiden Protagonisten müssen sich durch eine Reihe von gefährlichen Missionen kämpfen, bei denen sie auf hochgerüstete Gegner, verräterische Verbündete und ihre eigenen inneren Konflikte stoßen. Terry, der zunächst nur an seinem eigenen Überleben interessiert ist, entwickelt im Laufe der Zeit ein stärkeres Verantwortungsgefühl, während Bats mit seiner Vergangenheit und dem Verlust seiner Familie hadert.

Der Film erreicht seinen Höhepunkt in einem finalen Konflikt, bei dem Bats und Terry das Hauptquartier der Organisation infiltrieren, um die Experimente zu stoppen und die Wahrheit über die Machenschaften der Machthaber an die Öffentlichkeit zu bringen. Dabei werden sie mit moralischen Dilemmata konfrontiert, die ihre Entscheidungen und ihre Beziehung zueinander prägen. Der Film endet mit einem offenen Ausblick auf die Zukunft, der Raum für Interpretationen lässt, ob die Gesellschaft tatsächlich gerettet werden kann oder ob die Zyklen von Korruption und Gewalt weiterhin bestehen bleiben.