"Hardcore Hospital" (OVA) spielt in einer dystopischen Zukunft, in der ein Krankenhaus als Schauplatz für gewalttätige und bizarre Ereignisse dient. Die Handlung konzentriert sich auf eine Gruppe von Patienten und medizinischem Personal, die in einer surrealen und oft grotesken Umgebung gefangen sind. Das Krankenhaus selbst scheint lebendig zu sein, mit korridorförmigen Labyrinthen, die sich ständig verändern, und Räumen, die von unerklärlichen Phänomenen heimgesucht werden.

Die Hauptfigur ist ein junger Mann, der nach einem Unfall ins Krankenhaus eingeliefert wird. Schnell wird klar, dass die Einrichtung nicht dem entspricht, was man von einem normalen Krankenhaus erwarten würde. Die Ärzte und Krankenschwestern verhalten sich seltsam, oft grausam und sadistisch, während die Patienten unter mysteriösen Umständen verschwinden oder sich in monströse Kreaturen verwandeln. Der Protagonist versucht, den Sinn hinter den Geschehnissen zu verstehen und einen Weg zu finden, das Krankenhaus zu verlassen.

Im Verlauf der Geschichte trifft er auf andere Patienten, die ebenfalls versuchen, dem Chaos zu entkommen. Unter ihnen ist eine Frau, die behauptet, seit Jahren im Krankenhaus gefangen zu sein, und ein Mann, der von den Ärzten für Experimente missbraucht wurde. Gemeinsam durchqueren sie die verschiedenen Abteilungen des Krankenhauses, die jeweils ihre eigenen unheimlichen und tödlichen Herausforderungen bergen. Dabei stoßen sie auf absurde medizinische Geräte, die eher Folterinstrumenten ähneln, und auf Kreaturen, die aus menschlichen Körperteilen zusammengesetzt sind.

Die Handlung wird von einer düsteren Atmosphäre und einem Gefühl der Hoffnungslosigkeit geprägt. Die Charaktere sind ständig mit ihrer eigenen Sterblichkeit und dem Verlust ihrer Menschlichkeit konfrontiert. Die OVA endet mit einem offenen Finale, das Fragen über die Natur des Krankenhauses und das Schicksal der Überlebenden aufwirft.