Mitsuru, mit der Bezeichnung Code 326, ist ein Kinderparasit, der auf der Dreizehnten Plantage aufgezogen wurde, um in Jungen-Mädchen-Paaren riesige Mechas namens FRANXX zu pilotieren. Sein Hintergrund ist geprägt von einer kränklichen Kindheit und einem intensiven Verlangen, Pilot zu werden, was ihn dazu trieb, sich einer gefährlichen Elixier-Injektion zu unterziehen, um seine Kampffähigkeit zu steigern. Er schloss mit Hiro einen Kinderschwur, gemeinsam zu pilotieren, aber als Hiro diesen Eid zu vergessen schien, entwickelte Mitsuru eine tiefsitzende Rivalität und Groll gegenüber ihm. Diese Wunde prägte einen Großteil seiner frühen Persönlichkeit und machte ihn stolz, scharfzüngig, arrogant und zynisch. Er hasste es, bemitleidet zu werden, und weigerte sich, sich auf andere zu stützen, wobei er eine kalte und verschlossene Fassade zeigte.

Seine Hauptmotivation im Laufe der Geschichte ist es, sich Hiro gegenüber als überlegen zu erweisen und als fähiger Pilot anerkannt zu werden. Anfangs ist er mit Ikuno im FRANXX Chlorophytum gepaart, aber die Verbindung ist eher effizient als emotional eng. Im Verlauf der Serie beginnt sich Mitsuru zu verändern, nachdem er und Kokoro bei einem Strandausflug ein Buch über Schwangerschaft entdecken. Sie teilen ein Geheimnis, das zu tieferem Vertrauen heranwächst, und als seine Synchronisation mit Ikuno leidet, wird ein Partnerwechsel arrangiert. Mitsuru wird Kokoros Partner und pilotiert den FRANXX Genista. Durch Kokoros beharrliche Freundlichkeit und ihre eigene Bereitschaft, Versprechen für die Ehrlichkeit zu brechen, öffnet sich Mitsuru allmählich. Er lernt, sich auf andere zu verlassen, und gesteht schließlich seine Gefühle für Kokoro, was zu einer intimen Beziehung führt. Sie halten eine geheime Hochzeitszeremonie ab, für die die Behörden sie bestrafen, indem sie ihre Erinnerungen verändern. Trotzdem bleibt die Bindung stark, und als Kokoro mit ihrem Kind Ai schwanger wird, versöhnen sie sich und werden hingebungsvolle Eltern.

Mitsurus Charakterentwicklung zeichnet eine Reise von kalter Isolation und wettbewerbsorientierter Bitterkeit zu emotionaler Wärme, Vertrauen und der Bereitschaft, eine Zukunft jenseits der Grenzen des parasitären Systems aufzubauen. Seine Fähigkeit, einen FRANXX zu pilotieren, ist bemerkenswert, obwohl seine prägendste Fähigkeit sein Wachstum in emotionaler Verbindung ist, die es ihm ermöglicht, Liebe und menschliche Beziehungen in einer Welt zurückzugewinnen, die sie unterdrückt. Zu seinen wichtigsten Beziehungen gehören seine sich entwickelnde Rivalität, die zur Freundschaft mit Hiro wird, seine unterstützende Partnerschaft mit Ikuno und seine transformative Romanze mit Kokoro, die ihn letztendlich zu einem liebevollen Vater macht.