Ochiai ist ein Wissenschaftler und eines der Gründungsmitglieder des Unsterblichen Schiffs-Komitees, der verborgenen Regierungsinstanz des Generationenschiffs Sidonia. Etwa sieben Jahrhunderte vor den Hauptereignissen der Geschichte nahm er an der Untersuchung einer außerirdischen Struktur teil, wo die schimmelartige Substanz entdeckt wurde, die in der Lage ist, Gauna zu zerstören – ein Durchbruch, der der Menschheit ermöglichte, gegen die Kreaturen zurückzuschlagen. Zu jener Zeit hatte er bereits große Teile seines Körpers durch kybernetische Teile ersetzt, und in den folgenden Jahrhunderten modifizierte er sich weiter, während er sein Leben dem Studium der Gauna widmete. Er wird als der Forscher in Erinnerung behalten, der in der Geschichte der Sidonia dem Verständnis der Gauna am nächsten kam.

Seine lange Faszination wurde allmählich zu einer Besessenheit, die menschliche Spezies zu transzendieren. Er kam zu der Ansicht, dass die Abhängigkeit der Menschheit von festen biologischen Formen und das Konzept der Spezies ineffizient seien, und er suchte danach, ein Fusionsindividuum zu erschaffen – ein Wesen, das menschliche und Gauna-Merkmale vereint – als einen Schritt hin zu dem, was er als ultimative Lebensform und persönliche Wiedergeburt betrachtete. Etwa hundert Jahre vor der Hauptgeschichte, während des Vierten Gauna-Verteidigungskrieges, handelte er nach diesem Ehrgeiz, indem er sein eigenes Fusionsindividuum startete und aus eigener Autorität alle Kabizashi-Speere der Sidonia außerhalb des Schiffs entsorgte. Der Verlust dieser Waffen ermöglichte es zwei Gauna, in die Sidonia einzudringen und neunundneunzig Prozent der Bevölkerung zu töten. Sein Fusionsindividuum geriet außer Kontrolle, er wurde gefangen genommen und offiziell hingerichtet.

Vor seiner Verhaftung bewahrte er heimlich eine Kopie seines Bewusstseins in seinem versiegelten Labor in Form mikroskopischer künstlicher Lebensformen auf, die als Sidonia-Blutwürmer bezeichnet werden. Sein Wissen wurde stattdessen in einem großen Hilfsgehirn gespeichert, das vom Unsterblichen Schiffs-Komitee bewacht wurde, und sein ursprüngliches Gehirn wurde später in einen Klon mit gelöschten Erinnerungen transplantiert. Dieser Klon dient in der Haupthandlung als persönlicher Assistent und Agent von Kapitän Kobayashi, äußerlich kooperativ, aber mit Anklängen an den Charakter des Originals.

Als Kunato Norio, der Erbe des Kunato-Konzerns, in das versiegelte Labor eindringt, übertragen die Blutwürmer Ochiais Bewusstsein in seinen Körper. Von innerhalb der Machtstruktur der Sidonia unter Kunatos Identität arbeitend, nutzt Ochiai die Position des jüngeren Mannes als Leiter eines großen Waffenentwicklers, um heimlich die Erschaffung neuer Fusionsindividuen voranzutreiben, einschließlich Tsumugi Shiraui, während er ein ehrgeizigeres Gefäß für seinen eigenen Geist vorbereitet. Sein Ziel bleibt dasselbe wie vor einem Jahrhundert: sein Bewusstsein in einen perfektionierten Fusionskörper zu platzieren und die Grenzen der Menschheit hinter sich zu lassen.

In seiner Persönlichkeit ist Ochiai kalt, berechnend und rücksichtslos rational; er behandelt die Gauna eher als Studienobjekte und Objekte der Verehrung denn als Feinde. Er ist fest von seiner eigenen intellektuellen Überlegenheit überzeugt und neigt trotz jahrhundertelanger Erfahrung dazu, die Menschen um sich herum zu unterschätzen – ein Muster, das sich in seinen Auftritten wiederholt. Er wird auch als etwas eitel und beiläufig selbstgefällig gezeigt, mit einer Art, die gelegentlich seine Bedrohlichkeit untergräbt. Er bewahrt ein gewisses Maß an Sorge für bestimmte alte Kameraden, insbesondere für die Wissenschaftlerin Hiyama Lala, deren Lebenserhaltungsanzug er entworfen hat.

Seine Beziehungen sind weitgehend durch Ausbeutung und Rivalität geprägt. Kapitän Kobayashi ist eine ehemalige Kameradin und durch den Klon seine nominelle Vorgesetzte, aber letztlich nutzt er sie und das Komitee aus, statt ihnen wirklich zu dienen. Saito Hiroki ist der Kamerad, der seine Anomalie am frühesten erkannte und der ihn nach der großen Katastrophe gefangen nahm. Nagate Tanikaze erinnert ihn an Hiroki und wird zu der Person, die er stets nicht einzuplanen vermag. Kunato Norio ist sein Opfer und Wirt, dessen Körper und gesellschaftliche Stellung als Werkzeuge genutzt werden, während sein eigenes Bewusstsein beiseitegeschoben wird. Seine Schöpfungen, Tsumugi und das spätere Fusionsindividuum Kanata, verkörpern seinen Ehrgeiz, menschliche und Gauna-Biologie zu etwas Neuem zu verschmelzen.

In Bezug auf Fähigkeiten ist Ochiai ein Wissenschaftler von Genie, dessen Arbeit mehrere der wichtigsten Technologien der Sidonia untermauerte, einschließlich künstlichem Schimmel, Garde-Entwicklung und fortschrittlichen Lebenserhaltungssystemen. Er besitzt jahrhundertelang angesammeltes Wissen und, in seinem ursprünglichen Körper, eine umfassend modifizierte Form, die ohne Helm im Vakuum überleben kann. Seine charakteristische Fähigkeit ist der Sidonia-Blutwurm, ein Mittel, um seine Erinnerungen und Persönlichkeit auf eine andere Person zu kopieren und die Kontrolle über deren Körper zu übernehmen, was ihm effektiv eine Art Unsterblichkeit durch serielle Reinkarnation verleiht. In seiner endgültigen Form, erreicht durch die Übertragung seines Bewusstseins in das Fusionsindividuum Kanata, erlangt er einen Körper, der mit hochreinem Ultrastrukturmaterial gepanzert ist und mit einem Gravitationsstrahlungs-Emissionsgerät bewaffnet ist, was ihn mit konventionellen Mitteln nahezu unmöglich zu zerstören macht.

Seine Entwicklung zeichnet den Weg eines brillanten Beitragenden zum Überleben der Menschheit nach, der zu ihrem gefährlichsten inneren Feind wird. Jede Niederlage treibt ihn dazu, mehr von seiner Menschlichkeit aufzugeben, von einem stark modifizierten Menschen zu einem parasitären Bewusstsein zu einem unmenschlichen Fusionswesen. Er wird letztlich zerstört, als Nagate Tanikaze seine letzte Inkarnation besiegt, aber das Wissen und die Technologie, die er hinterlassen hat, prägen weiterhin das Überleben der Sidonia, selbst nach seinem Ende.