Kotarō Yanagisawa, zunächst bekannt unter dem Alias Shiro, ist ein zentraler Antagonist der Geschichte. Er ist ein brillanter, aber ethisch bankrotter Wissenschaftler aus einer wohlhabenden Familie, die ein Biounternehmen betreibt. Schon in jungen Jahren zeigte er bemerkenswerte wissenschaftliche Begabung, aber es mangelte ihm an Empathie oder moralischer Zurückhaltung; er betrachtete andere Menschen als Werkzeuge, die er für seine eigenen Zwecke einsetzen konnte. Seine Persönlichkeit ist geprägt von Arroganz, einer kalt manipulativen Art und einem tiefsitzenden Glauben, dass sein Genie jede Handlung rechtfertigt. Er gibt sich eine ruhige und lockere Fassade, wenn es ihm nützt, aber diese verbirgt eine rücksichtslose Natur; er ist bereit, jeden zu opfern, einschließlich seiner eigenen Verlobten und kindlichen Verbündeten, ohne zu zögern. Seine Hauptmotivation ist gekränkter Stolz und ein brennendes Verlangen nach Rache an Koro-sensei, dem Versuchsobjekt, das seiner Kontrolle entkam und sein Lebenswerk zerstörte, wodurch er entstellt und gedemütigt wurde. Er wird nicht von einem wissenschaftlichen Ideal getrieben, sondern von einer persönlichen Vendetta, um seinen verlorenen Ruf wiederherzustellen und seine Überlegenheit zu beweisen. In der Geschichte ist Yanagisawa die direkte Ursache des zentralen Konflikts: Seine experimentelle Antimaterie-Forschung erschuf die Tentakel, verwandelte den als Todesgott bekannten Attentäter in Koro-sensei und verursachte indirekt die Zerstörung von siebzig Prozent des Mondes. Er agiert als heimlicher Drahtzieher, manipuliert zunächst den Jungen Itona Horibe, indem er ihm Tentakel implantiert und ihn als Attentäter einsetzt, und beobachtet und berät später heimlich seine Schwägerin Kaede Kayano, während diese ihre eigene Rache plant. Als beide dieser indirekten Methoden scheitern, übernimmt er eine direktere Rolle und implantiert sich schließlich selbst Tentakel, um Koro-sensei in einem letzten, verzweifelten Kampf persönlich gegenüberzutreten. Seine wichtigsten Beziehungen sind von Ausbeutung geprägt. Seine arrangierte Verlobung mit Aguri Yukimura war rein transaktional, und er misshandelte sie verbal und körperlich, da er sie als entbehrliches Gut betrachtete. Ihr Tod nährt einen Teil seines Hasses, obwohl er Koro-sensei und nicht sich selbst die Schuld gibt. Er benutzt Itona Horibe als Waffe und lässt den Jungen nach wiederholten Misserfolgen kalt fallen. Er hat eine komplizierte Vergangenheit mit Kaede Kayano, Aguris jüngerer Schwester, verhält sich freundlich zu ihr, als sie ein Kind war, manipuliert sie aber später als weiteres Werkzeug für Attentate. Seine Beziehung zu Koro-sensei ist eine von obsessivem Hass; er kann dem ehemaligen Versuchsobjekt nicht vergeben, dass es entkam, ihn verletzte und den Zusammenbruch seines Projekts verursachte. Im Laufe der Geschichte entwickelt sich Yanagisawas Charakter von einem hinterhältigen Intriganten, der durch Stellvertreter handelt, zu einem verzweifelten Fanatiker, der seine eigene Menschlichkeit opfert. Er wird zunehmend wahnsinniger, als seine Pläne scheitern, was in einem letzten Akt gipfelt, in dem er sich Tentakel injiziert und sich in ein Monster verwandelt. Diese Verwandlung führt letztlich zu seiner Niederlage, da Koro-senseis Zorn dazu führt, dass Yanagisawa kritisch verletzt wird, dauerhaft an ein Lebenserhaltungssystem gebunden bleibt und seiner Macht und Ambitionen beraubt wird. Was die Fähigkeiten betrifft, ist Yanagisawa ein genialer Wissenschaftler und der Schöpfer der Tentakel-Technologie. Er entwickelt eine Reihe von Anti-Sensei-Waffen und -Geräten, darunter spezielle Fasern für seinen weißen Anzug und seine Maske, prothetische Augen mit offensiven Fähigkeiten und Technologie zur Stimmveränderung. Er kennt auch die Schwächen und die Biologie von Koro-sensei, da er der leitende Forscher des ursprünglichen Experiments war. In seiner letzten Konfrontation zeigt er körperliche Kampffähigkeiten, die durch die Tentakel, die er sich selbst implantiert, verstärkt werden, obwohl dies eine rücksichtslose und unvollkommene Nachahmung der Macht ist, die er zu kontrollieren suchte.