Der Live-Action-Film von 2013, 009-1: The End of the Beginning, ist eine japanische Adaption der Manga-Serie von Shotaro Ishinomori. Die Geschichte spielt in einer alternativen Realität, in der der Kalte Krieg nie endete, sondern über ein Jahrhundert andauerte und die Welt in zwei gegnerische Supermachtblöcke teilte: den Westen und den Osten. Diese verlängerte Periode der Spannung und Spionage dient als Hintergrund für die Erzählung.

Die Hauptfigur ist Mylene Hoffman, eine Top-Agentin für den Westblock, bekannt unter dem Codenamen 009-1. Als Waise aus dem Ostsektor, die im Westen geborgen und aufgezogen wurde, wurde Mylene in einen mächtigen Cyborg verwandelt, ihr Körper mit verschiedenen verdeckten Waffen und übermenschlichen Fähigkeiten ausgestattet, um in der Zero Zero Organization, einer geheimen Nachrichtendienstagentur, zu dienen. Zu Beginn ist sie auf einer Mission, einen Menschenhandelsring zu zerschlagen, eine Aufgabe, die sie mit bemerkenswerter Gelassenheit und tödlicher Effizienz erledigt. Während dieser Operation rettet sie einen jungen Mann namens Chris, der ein Gefangener zu sein scheint. Chris summt ein Wiegenlied, das tiefe, fragmentierte Erinnerungen an Mylenes Kindheit auslöst, insbesondere an einen Bruder namens Paul, von dem sie gewaltsam getrennt wurde.

Mylenes Hauptmission wird schnell die Bergung eines vermissten Wissenschaftlers, Dr. Klein, der Frau, die sie ursprünglich in einen Cyborg verwandelte und als Mentorin fungiert. Nach einem gescheiterten Rettungsversuch, bei dem Dr. Klein von einer mächtigen weiblichen Cyborg-Agentin zurückerobert wird, wird Mylene ihres Agentenstatus enthoben. Sie setzt ihre Suche unabhängig fort, getrieben von dem Bedürfnis, ihre Schöpferin zu finden und ihre eigene Vergangenheit zu verstehen. Die Spur führt zu einer Konfrontation, in der sie entdeckt, dass Dr. Klein als Doppelagentin gearbeitet und fortschrittliche Technologie auf der Grundlage der Erschaffung künstlichen Lebens entwickelt hat. Die erschütterndste Enthüllung betrifft Chris, der sich als Loki entpuppt, ein Meisterspion aus dem Ostblock. Loki ist in Wirklichkeit Mylenes lang verlorener Bruder, Paul, nun erwachsen und ein feindlicher Agent.

Die Erzählung folgt Mylene, während sie gezwungen ist, ihre konstruierte Identität und ihre unterdrückte Geschichte zu konfrontieren. Ihre Mission entwickelt sich von einem einfachen Spionageauftrag zu einer persönlichen und psychologischen Prüfung, die sie gegen ihre eigene Schöpferin und ihren entfremdeten Bruder stellt. Der Höhepunkt beinhaltet, dass Mylene gegen den fortschrittlichen Cyborg kämpft, den Dr. Klein erschaffen hat, und sich direkt Loki stellt. Sie zerstört schließlich den feindlichen Cyborg und tötet ihren Bruder, womit sie ihre Mission abschließt, indem sie Dr. Kleins Gehirn zu ihren Vorgesetzten zurückbringt. Der Film endet damit, dass Mylenes Status als einzigartig effektiver, wenn auch emotional vernarbter, mechanischer Agent bekräftigt wird, nachdem sie die letzten Verbindungen zu ihrer menschlichen Vergangenheit gekappt hat.