"Clockwork Planet" ist eine Manga-Serie, die in einer dystopischen Zukunft spielt, in der die Erde durch ein katastrophales Ereignis zerstört wurde und nur durch ein komplexes System von Zahnrädern, bekannt als der "Uhrwerk-Planet", am Leben erhalten wird. Die Gesellschaft ist abhängig von dieser mechanischen Infrastruktur, die von genialen Ingenieuren, den sogenannten "Meisteruhrmachern", gewartet wird. Die Handlung beginnt mit Naoto Miura, einem jungen, begabten, aber sozial isolierten Highschool-Schüler, der ein außergewöhnliches Gehör besitzt, das es ihm ermöglicht, selbst die kleinsten mechanischen Fehler zu erkennen. Eines Tages stürzt ein mysteriöser humanoider Automat, RyuZU, in sein Leben. Sie ist eine der legendären "Initial-Y-Serie"-Automaten, die als die fortschrittlichsten ihrer Art gelten.

RyuZU wurde von Naotos verstorbenem Großvater geschaffen und ist seit Jahrhunderten inaktiv. Durch Naotos Fähigkeiten erwacht sie zum Leben und schließt sich ihm an. Zusammen mit Marie Bell Breguet, einer jungen und talentierten Meisteruhrmacherin, und ihrem loyalen Automaten-Anhalt, beginnen sie, die Geheimnisse des Uhrwerk-Planeten zu erforschen. Dabei stoßen sie auf eine Verschwörung, die die fragile Balance der Welt bedroht. Marie, die aus einer angesehenen Familie von Uhrmachern stammt, ist entschlossen, die Wahrheit hinter den mysteriösen Vorfällen zu enthüllen, die die Mechanik des Planeten stören.

Im Laufe der Geschichte werden die Charaktere mit politischen Intrigen, gefährlichen Gegnern und den Grenzen der menschlichen und mechanischen Existenz konfrontiert. Die Serie untersucht Themen wie die Beziehung zwischen Mensch und Maschine, die Verantwortung der Schöpfer gegenüber ihren Kreationen und die moralischen Dilemmata, die mit technologischem Fortschritt einhergehen. Die Handlung ist geprägt von actionreichen Szenen, technischen Details und emotionalen Momenten, die die Entwicklung der Charaktere und ihrer Beziehungen zueinander vorantreiben. "Clockwork Planet" bietet eine Mischung aus Science-Fiction, Abenteuer und Drama, die in einer einzigartigen, mechanisch geprägten Welt angesiedelt ist.