Am 6. Juni 2031 nimmt der Grundschüler Yuuma Ashihara am Playtest eines revolutionären Virtual-Reality-MMORPGs namens Actual Magic teil. Zunächst ist er von der realistischen Fantasy-Welt des Spiels begeistert, doch die Erfahrung schlägt schnell in einen Albtraum um, als er versucht, sich auszuloggen. Die Grenzen zwischen der digitalen Sphäre und der realen Welt beginnen zu verschmelzen, was dazu führt, dass das Chaos seine Realität überflutet.

Während die Fusion fortschreitet, entdeckt Yuuma, dass die Spielmechaniken und Monster in seiner eigenen Stadt auftauchen. Auf der verzweifelten Suche nach Antworten trifft er seine Klassenkameradin Sumika Watamaki, die zuvor als eines der niedlichsten Mädchen ihres Jahrgangs galt. Sie hat eine schreckliche Metamorphose durchgemacht und sich in eines der furchterregenden Monster des Spiels verwandelt. Yuuma erkennt, dass dies nicht länger nur ein Spiel ist; am Leben zu bleiben ist der Beginn einer neuen, tödlichen Herausforderung, bei der der Tod hinter jeder Ecke lauert.

Die Geschichte folgt Yuuma und seiner Zwillingsschwester Sawa, während sie sich in dieser neuen hybriden Existenz zurechtfinden, in der die Regeln von Actual Magic auf die physische Welt anwendbar sind. Während sie ums Überleben kämpfen, treffen sie auf andere Klassenkameraden, die ebenfalls in die Krise hineingezogen wurden, von denen jeder möglicherweise einzigartige Fähigkeiten erlangt, die an Spielklassen wie Magier, Krieger, Mönch, Dieb oder Jäger gebunden sind. Yuuma selbst übernimmt die Rolle eines Tamers oder Monster-Tamers, der ihm erlaubt, Kreaturen in dieser gemischten Realität zu befehligen. Der zentrale Konflikt dreht sich darum, zu verstehen, warum das Spiel die Realität verschlingt, und einen Weg zu finden, den Prozess umzukehren, während man mit der Bedrohung durch verwandelte Personen wie Sumika umgeht.

Die Erzählung ist um mehrere Schlüsselbögen strukturiert. Die Geschichte beginnt mit dem Realitätserosion-Bogen, der die anfängliche Katastrophe und den unmittelbaren Kampf um das Verständnis der Regeln der fusionierten Welt abdeckt. Darauf folgt der Anderwelt-Manifestation-Bogen, in dem sich die Spielwelt weiter in die Realität ausdehnt und die Überlebenden beginnen, einen Anschein von Ordnung herzustellen und das Ausmaß ihrer neuen Kräfte zu entdecken. Spätere Bögen wie Dämonenerwachen und Hegemoniekampf konzentrieren sich auf das Aufkommen mächtiger Gegner unter den Überlebenden und die daraus resultierenden Machtkämpfe, während verschiedene Gruppen um die Kontrolle über das Schicksal der neuen Welt kämpfen. Der Manga präsentiert eine einzigartige Interpretation des Death-Game-Genres, die über reine Virtual Reality hinausgeht und in einen Zustand übergeht, in dem Spiel und Realität ein und dasselbe sind.