Im verfluchten Dorf Inakamura, das von einem ewigen Nebel abgeschnitten ist, der Zeit und Gedächtnis verzerrt, folgt die Geschichte Yuuki Tachibana, einem Jungen, der von Geburt an mit dem Jūjika gezeichnet ist – einem kreuzförmigen Muttermal, das kein Zeichen der Heiligkeit, sondern ein Leuchtfeuer für die Jashin ist, parasitäre Dämonen, die aus menschlicher Verzweiflung geboren werden. Anders als die Dorfbewohner, die ihre Male verbergen und in Angst leben, kann Yuuki seines nicht verstecken. Als seine Mutter von einem hochrangigen Jashin namens Der Puppenspieler entführt wird, erfährt Yuuki das dunkle Geheimnis des Dorfes: Die Jashin wurden von den eigenen Vorfahren der Dorfbewohner erschaffen, um einer Pest zu entkommen, und nun muss die Schuld jede Generation beglichen werden.

Der Hauptkonflikt beginnt, als Yuuki Shiori Amamiya trifft, eine Schreinmädchen von außerhalb des Dorfes, die gekommen ist, um die Jashin endgültig zu versiegeln. Shiori besitzt die Kuchizuke no Ken, eine verbotene Technik, die einen Jashin zerstören kann, aber einen Kuss absoluten Vertrauens mit einem Jūjika-Träger benötigt, um aktiviert zu werden. Ihr erster Kuss, geboren aus Verzweiflung statt Vertrauen, scheitert – er verbrennt Yuuki und tötet Shiori fast. Aus diesem Versagen lernen sie, dass die Technik nur funktioniert, wenn der Träger seinen Fluch als Teil seiner selbst akzeptiert, nicht als etwas, das entfernt werden muss.

Die Besetzung erweitert sich um Kaito Murakami, einen zynischen Träger, der gelernt hat, seinen Jashin zu kontrollieren, indem er einen Pakt mit ihm schließt, und so zu einer gefährlichen neutralen Partei wird. Reina Hoshino ist eine Trägerin, die vor Jahren aus dem Dorf floh und nun als Jashin-Jägerin zurückkehrt, da sie glaubt, die einzige Lösung sei, jede gezeichnete Person zu töten, um die Dämonen auszuhungern. Vater Enoki ist der Dorfpriester, der das ursprüngliche Gebet kennt, das die Jashin erschuf, sich aber weigert, es auszusprechen, weil er glaubt, die Dämonen verdienen es, als Strafe für die Sünden der Vorfahren zu existieren.

Die Erzählung entfaltet sich durch bemerkenswerte Handlungsbögen. Im Pakt-Bogen versucht Yuuki Kaitos Methode, einen Deal mit seinem Jashin zu machen, was ihm Macht verleiht, aber beginnt, ihn in einen Dämon zu verwandeln. Der Siegel-Bogen führt Yuuki und Shiori in die Dimension der Jashin, die Falte, wo die Zeit anders verläuft und sie physischen Manifestationen ihrer schlimmsten Erinnerungen gegenüberstehen müssen. Der Verrat-Bogen enthüllt, dass Shioris Orden nie vorhatte, die Jashin zu versiegeln – sie wollen die Dämonen für militärische Zwecke einfangen, und sie ist eine Schläferagentin, die programmiert ist, Yuuki im Moment des letzten Kusses zu verraten. Der Geständnis-Bogen ist der emotionale Höhepunkt, wo Yuuki, nun halb verwandelt, sich dennoch entscheidet, Shiori zu vertrauen, und sie durch reinen Willen ihre Programmierung durchbricht. Ihr letzter Kuss aktiviert die Kuchizuke no Ken nicht als Waffe, sondern als Reinigung, die die Jashin in die Traurigkeit zurückverwandelt, aus der sie kamen.

Die Geschichte löst sich auf, als Yuuki die Jashin nicht zerstört, sondern stattdessen sein Mal nutzt, um sie alle in sich aufzunehmen und so ein lebendiges Gefängnis zu werden. Shiori versiegelt ihn in einem neuen Schrein, und die letzte Szene zeigt, wie sie ihn jedes Jahr besucht und ihre Hand auf den Stein legt, wo sein Herzschlag noch gespürt werden kann. Der Nebel lichtet sich über Inakamura, aber Yuuki bleibt darin eingeschlossen und trägt die Last jedes Dämons, damit niemand anderes es muss.