In den zerfallenden Hallen von Genen no Shiro, einer Festung, die zwischen der Geisterwelt und der Welt der Lebenden gefangen ist, erwacht ein junger Junge namens Navin ohne Erinnerung daran, wer er ist oder wie er dorthin gelangte. Die Burg ist ein labyrinthisches Gefängnis für vergessene Seelen und verfluchte Wesen, alle gefangen durch ein jahrhundertealtes Ritual, das schrecklich schiefging. Navin entdeckt, dass er die seltene Fähigkeit besitzt, die wahren Namen der Dinge zu sehen – eine Macht, die die Flüche, die die Bewohner binden, entweder brechen oder für immer verstärken kann. Geführt von einem scharfzüngigen Fuchsgeist namens Kitsu, die ihre eigenen geheimnisvollen Verbindungen zum Fall der Burg hat, beginnt Navin, die sich ständig verändernden Korridore der Festung zu durchqueren. Jede Ebene von Genen no Shiro repräsentiert eine andere Art des Vergessens: gelöschte Geschichten, gestohlene Identitäten und nie betrauerte Lieben. Der Hauptantagonist ist der Schatten-Kastellan, eine Gestalt, die aus der kollektiven Trauer der Burg geformt ist und versucht, Navins Macht zu nutzen, um die Grenze zwischen den Welten vollständig auszulöschen und beide Reiche in Stille zu stürzen. Bemerkenswerte Handlungsbögen umfassen Navins Konfrontation mit der Halle der Zersplitterten Spiegel, wo er Fragmente seines eigenen vergangenen Ichs vor rachsüchtigen Reflexionen zurückerobern muss, und den Abstieg in die Wurzelgewölbe, wo der wahre Ursprung des Fluchs als ein verratener Pakt zwischen menschlichen Wächtern und Geisteradligen enthüllt wird. Während Navin den verlorenen Bewohnern ihre Namen zurückgibt, verwandelt er die Festung langsam von einem Grab in ein Heiligtum, was zu einer endgültigen Entscheidung führt, bei der er wählen muss, ob er die Tore öffnen und alle in eine Welt zurückkehren lassen soll, die sie nicht mehr kennt, oder ob er als ewiger Hüter der Vergessenen bleiben will.