Neun Jahre nachdem Außerirdische die Erde vor einem Asteroideneinschlag gerettet und als Helden gefeiert wurden, leben sie nun Seite an Seite mit den Menschen in Japan und genießen einen privilegierten und unantastbaren Status. Die Gesellschaft feiert sie, doch diese Harmonie verbirgt eine tiefsitzende Verbitterung bei denen, die die Aliens als arrogante Herren sehen, die auf die Menschheit herabblicken. In diesem angespannten Umfeld kämpft Nomamoto, eine Fabrikarbeiterin, die in einem Job ohne Zukunft mit einem missbräuchlichen Alien-Chef gefangen ist, mit ihrem brodelnden Hass auf die Wesen, die sie für ihr Elend verantwortlich macht.

Nomamotos Leben ändert sich, als sie Kitami trifft, einen neuen Kollegen, dessen Familie von Aliens ermordet wurde. Ihre gemeinsame Wut schmiedet eine düstere Freundschaft, doch Kitami treibt ihre Mission auf die Spitze, indem er eine unvorstellbare Tat begeht: Er tötet einen Alien und bringt die Leiche zu Nomamoto. Dieses Ereignis stürzt sie in eine gewalttätige Verschwörung, bei der Kitami Aliens ermordet, während Nomamoto die Leichen auf schockierende Weise beseitigt, indem sie sie verzehrt, weil sie sie köstlich findet. Die beiden Außenseiter radikalisieren sich und stellen sich sowohl gegen die Alien-Bevölkerung als auch gegen die menschliche Gesellschaft, die sie verehrt.

Die Erzählung weitet sich über ihren anfänglichen Rachefeldzug hinaus aus, als ein mysteriöser Alien namens Lily in die Geschichte eintritt. Lily, die mit der Tragödie verbunden ist, die Kitamis Familie zerstörte, wird zu einer unwahrscheinlichen Verbündeten, die ihm hilft, andere Aliens zu töten und sogar sein Leben rettet. Dieses Bündnis zwingt Kitami, sich mit der starren Wir-gegen-Sie-Logik seines Kreuzzugs auseinanderzusetzen, besonders nachdem er entdeckt, dass der wahre Mörder nicht Lily, sondern ihr Zwillingsbruder Lally war. Ein nachfolgender Handlungsbogen taucht in Lallys Vergangenheit ein und zeigt ihn nicht als monströsen Mörder, sondern als jungen Alien-Jungen, der in der Schule gemobbt und isoliert wurde und vor dem tödlichen Vorfall in Kitamis Schwester verliebt war. Diese Enthüllung verkompliziert die Moral der Erzählung und zeigt, wie Vorurteile, soziales Privileg und der Schutz einer herrschenden Klasse Gewaltzyklen von allen Seiten aufrechterhalten können. Im Verlauf der Serie schließen sich Figuren wie Backbone den beiden bei ihren Missionen an, und die Geschichte erforscht weiterhin Themen wie systemische Ungerechtigkeit, Trauma und die hässliche Realität, ein Monster zu werden, um Monster zu bekämpfen.