Ein junges Waisenmädchen namens Yotori verlor ihre Eltern und arbeitet nun allein an einem ländlichen Dorfschrein, wo sie trotz ihrer geringen Statur ein starkes und widerstandsfähiges Leben führt. Ihr Leben wird geprägt von ihrer tiefen Zuneigung zu dem Drachengott, den sie als Vaterfigur betrachtet. Ihre Welt erweitert sich dramatisch, nachdem sie auf Toyokitsu trifft, den Sohn des Kaisers, der ein Nachkomme desselben Drachengottes ist. Diese Begegnung wird zum Katalysator, der in Yotori einen tiefen Groll in ihrem eigenen Körper aufkeimen lässt. Die Geschichte entfaltet sich als eine Erzählung voller Trauer und Zärtlichkeit, die sich um die komplexen Gefühle und anhaltenden Ressentiments der Götter selbst dreht.