Miyoshi hat seine gesamte Schulzeit damit verbracht, mit seiner Kindheitsfreundin Mamiya zu konkurrieren, nur um jedes Mal zu verlieren. Mamiya glänzt in akademischen Fächern, im Sport und in allem anderen, und die Rivalität prägt ihre Beziehung. Eines Tages bricht Mamiya aufgrund einer Krankheit zusammen und wird für mehrere Wochen ins Krankenhaus eingeliefert. Als er zur Schule zurückkehrt, hat sich sein Aussehen verändert: längeres Haar, eine zierlichere Statur und eine deutlich feminine Figur. Es stellt sich heraus, dass Mamiya das durchgemacht hat, was in dieser Welt als Emergenz bekannt ist – ein biologischer Prozess, bei dem eine genetische Veranlagung dazu führt, dass sich einige Jungen während der Pubertät in Mädchen verwandeln. Die Veränderung ist praktisch dauerhaft, und die Gesellschaft akzeptiert sie als ein natürliches, wenn auch ungewöhnliches Phänomen. Mamiya beschließt, als Mädchen zu leben, sehr zum Entsetzen von Miyoshi.

Die Geschichte spielt in einem zeitgenössischen japanischen Schulumfeld, in dem diese Verwandlung nicht völlig unbekannt ist. Die Erzählung folgt Miyoshi, der darum kämpft, seine Gefühle gegenüber der Person, die einst sein Rivale war und nun ein Mädchen ist, in Einklang zu bringen. Trotz seines anfänglichen Schocks und seiner selbst erklärten Abneigung gegen Mädchen findet sich Miyoshi allmählich mit der neuen Situation ab. Die Beziehung zwischen den beiden vertieft sich, entwickelt sich von Rivalität zu Romantik, und die Serie zeichnet ihren Weg durch die Oberschule, die Universität und darüber hinaus nach. Zu den bemerkenswerten Handlungsbögen gehören ihr heimliches Date während der Universitätszeit, die Missbilligung durch Miyoshis Cousin Takehiko, das Kennenlernen der jeweiligen Familien und schließlich Heirat und Elternschaft. Die Verwandlung wird nicht als vorübergehender Gag behandelt, sondern als dauerhafte Veränderung, die beide Charaktere dazu zwingt, Identität, Anziehung und die Bedeutung von Liebe zu überdenken.

Die Hauptfiguren sind Miyoshi, der stachelig und wettbewerbsorientiert ist, aber fürsorglicher wird, und Mamiya, die sich mit überraschender Leichtigkeit an ihren neuen Körper anpasst und ihren scharfen Verstand und ihr selbstbewusstes Wesen bewahrt. Weitere Schlüsselfiguren sind Takehiko, Miyoshis beschützender älterer Cousin, und später eine neue Generation von Charakteren in der Spin-off-Serie Kanojo ni Naru Hi Another, die sich auf einen Mittelschuljungen namens Sagara konzentriert, der emergiert und seine Gefühle für eine Mitschülerin navigieren muss, während er darum kämpft, seine eigene Verwandlung zu akzeptieren. Die Originalserie umfasst zwanzig Kapitel, die in vier Bänden gesammelt sind, und deckt den gesamten Bogen von Mammyas Emergenz bis zum Eheleben des Paares ab.