Little Busters! EX The 4-Koma ist eine Fortsetzung der früheren Vier-Panel-Gag-Manga Little Busters! The 4-Koma, die selbst auf dem Key-Visual-Novel Little Busters! Ecstasy basiert. Die Geschichte kehrt zum Highschool-Leben des Protagonisten Riki Naoe und seinem Freundeskreis, den Little Busters, zurück. Als Waise wurde Riki aus seiner Depression von dem Gründer der Gruppe, Kyousuke Natsume, geholt und ist seitdem seinen Klassenkameraden nahegekommen: Kyousukes jüngerer Schwester Rin, dem muskelbesessenen Masato Inohara, dem stoischen Kengo Miyazawa, der sanften Komari Kamikita, der energiegeladenen Kudryavka Noumi, der reifen Yuiko Kurugaya, der schüchternen Mio Nishizono und der schelmischen Haruka Saigusa. In dieser Fortsetzung erweitert sich der Fokus auf drei neue Charaktere, die in der Ecstasy-Version des Visual Novels eingeführt wurden: Saya Tokido, eine mysteriöse Transferstudentin, die wie eine Geheimagentin wirkt; Sasami Sasasegawa, ein Mädchen mit einem Komplex wegen ihrer Körpergröße; und Kanata Futaki, die strenge Schulsprecherin. Der Manga ist als eine Reihe kurzer, komödiantischer Vignetten strukturiert, die die alltäglichen Possen und Interaktionen dieser erweiterten Besetzung hervorheben. Ein Großteil des Humors stammt von Sayas spionagethema-bezogenen Missgeschicken, Kyousukes ausgefallenen selbsternannten Missionen und dem spielerischen Geplänkel der Gruppe. Obwohl es keine übergreifende dramatische Handlung gibt, umfassen wiederkehrende Erzählstränge Sayas Versuche, ihre geheime Identität zu verbergen, die gemeinsamen Schulprojekte der Gruppe und ihre allgemeinen Bemühungen, ihre Jugend gemeinsam zu genießen. Die Umgebung bleibt dieselbe Schule und die umliegende Stadt, wodurch die Slice-of-Life-Atmosphäre der Originalserie erhalten bleibt.