In Nord-Kamakura, versteckt in einer ruhigen Gasse nahe des Bahnhofs, steht Biblia Koshodou, ein Antiquariat, das sich auf die Lösung von Problemen im Zusammenhang mit alten und seltenen Büchern spezialisiert hat. Die Geschichte folgt Shinokawa Tobirako, einer Zehntklässlerin und Tochter des Buchhändlers Shioriko. Tobirako beginnt, bei den speziellen Beratungen des Ladens zu helfen, und betritt eine Welt, in der jedes antiquarische Buch nicht nur seine gedruckten Worte, sondern auch die verborgenen Geschichten und Geheimnisse seiner früheren Besitzer birgt.

Die Serie beginnt im frühen Frühling bei leichtem Regen, als ein neuer Fall im Laden eintrifft: eine mysteriöse Sammlung von etwa tausend Büchern, die in einem anderen Antiquariat zurückgelassen wurde. Die Absichten der verschiedenen Personen, die mit diesen Büchern verbunden sind, sind verworren, und es liegt an Tobirako, die Wahrheit zu entwirren. Während sie bei dieser und den folgenden Beratungen hilft, kreuzt sie den Weg mit Kyoichiro, einem jungen Mann, dessen eigene Familiengeschichte eng mit den Fällen verwoben ist. Kyoichiros Vater verschwand vor Jahren und hinterließ eine schwangere Frau, und die unbeantworteten Fragen dieses Verlassens tauchen wieder auf, als Tobirako und Kyoichiro eine Reihe von Hinweisen untersuchen, die in den Büchern versteckt sind.

Der zentrale Handlungsbogen dreht sich um das Verschwinden von Kyoichiros Vater Yasuaki und die Spur von Hinweisen, die zu dem legendären japanischen Roman Dogura Magura von Yumeno Kyusaku führen, einem der drei großen seltsamen Bücher Japans. Als Tobirako und Kyoichiro tiefer graben, spüren sie eine Verbindung zwischen der verdrehten Erzählung von Dogura Magura und Yasuakis Verschwinden. Die Untersuchung wird komplexer, als Kyoichiros Großvater Sugio wieder auftaucht und enthüllt, dass eine Nachdruckausgabe aus Yasuakis Buchsammlung heimlich durch eine Erstausgabe ersetzt wurde. Diese Entdeckung drängt Tobirako dazu, die Motive der Beteiligten zusammenzusetzen und die Wahrheit der Vergangenheit aufzudecken. Die Geschichte ist ein Bibliomysterium, das die Liebe zu alten Büchern, das Gewicht von Familiengeheimnissen und die Entschlossenheit einer jungen Frau verwebt, die ihr Wissen und ihre scharfe Intuition nutzt, um die Rätsel zu lösen, die in den Seiten vergessener Bände zurückgelassen wurden.