In einer ruhigen Ecke von Kamakura ist eine kleine Antiquariatsbuchhandlung namens Biblia Koshodō der Schauplatz einer Reihe literarischer Rätsel. Die Besitzerin, Shioriko Shinokawa, ist eine auffallend schöne junge Frau, deren extreme Schüchternheit alltägliche Gespräche zur Qual macht. Wenn das Gespräch jedoch auf antiquarische Bücher kommt, überwindet ihre Leidenschaft ihre Scheu, und sie wird zu einer eloquenten und scharfsinnigen Geschichtenerzählerin. Ihr tiefes Wissen über alte Bücher wird nur von ihren scharfen Beobachtungsfähigkeiten übertroffen, und sie besitzt die seltene Fähigkeit, die Geheimnisse zu lüften, die jeder Band birgt.

Die Geschichte beginnt, als Daisuke Gōra, ein junger Mann, der mit einer Lesephobie aufgewachsen ist, eine Sammlung der Bücher seiner verstorbenen Großmutter zur Begutachtung bringt: die Gesamtwerke von Natsume Sōseki, wobei jeder Band die Unterschrift des Autors zu tragen scheint. Daisuke hatte Shioriko einst in der Oberschule gesehen und war von ihrer Ausstrahlung beeindruckt, und ihr zufälliges Wiedersehen in der Buchhandlung setzt ihre Beziehung in Gang. In den Bann des Ladens gezogen, wird Daisuke Teilzeitassistent, und gemeinsam begegnen sie einem stetigen Strom eigenartiger Gäste, die jeweils ein altes Buch mit sich führen, das ein persönliches Geheimnis, eine vergessene Geschichte oder ein delikates Rätsel birgt.

Der Manga verwebt eigenständige Episoden und längere Erzählbögen. Frühe Fälle betreffen eine signierte Sōseki-Sammlung mit einer versteckten Botschaft, einen fehlenden Gedichtband, der mit einer Familienzerrüttung zusammenhängt, und eine seltene Ausgabe eines Kinderbuchs, das einen Hinweis auf ein jahrzehntealtes Verschwinden enthält. Im Laufe der Zeit werden die Rätsel persönlicher. Shioriko enthüllt, dass sie nicht durch einen Sturz verletzt wurde, sondern gestoßen wurde, und die Untersuchung, wer sie angegriffen hat und warum, wird zu einem zentralen Handlungsstrang. Daisukes eigene Vergangenheit rückt in den Fokus, als die Bücher seiner Großmutter und ihre Verbindung zu Shiorikos Familie erforscht werden. Die Beziehung zwischen der schüchternen, buchbesessenen Ladenbesitzerin und dem mürrischen, nicht lesenden Assistenten vertieft sich allmählich, verankert durch ihre gemeinsame Neugier und ihr wachsendes Vertrauen.

Die Serie zeichnet sich durch ihren Fokus auf echte, oft obskure antiquarische Bücher aus. Jeder in der Geschichte vorkommende Titel ist ein tatsächlich veröffentlichtes Werk, und die Handlungen stützen sich auf die physischen und historischen Details dieser Bücher: Randnotizen, Inschriften, Veröffentlichungsbesonderheiten und Herkunft. Die Kulisse in Kamakura mit seinen Tempeln, ruhigen Straßen und der Meeresatmosphäre bietet einen sanften Hintergrund, der den intellektuellen und emotionalen Ton der Erzählungen ergänzt. Die Manga-Adaption folgt eng der ursprünglichen Light-Novel-Reihe, deckt die frühen Bände und die Haupthandlung um Shioriko und Daisuke ab, wobei spätere Manga-Ausgaben in die zweite Generation der Charaktere fortgeführt werden.