Choco Mona! dreht sich um den Haushalt der Familie Katori, in dem die Ankunft der dreijährigen Nichte Monaka den Alltag auf den Kopf stellt. Monaka ist ein frühreifes und unschuldiges Kind, dessen spontane Worte und Handlungen ihre Familie ständig verwirren und erfreuen. Die Geschichte folgt hauptsächlich Chiseko Katori, Monakas Tante und Universitätsstudentin, die oft für ihre energiegeladene Nichte verantwortlich ist. Trotz des Chaos, das Monaka verursacht, erobert ihr Charme aller Herzen, und die Familie – einschließlich Chisekos Eltern – ist völlig von ihr eingenommen. Der Manga ist eine Slice-of-Life-Komödie im Vierkasten-Format, die die warmherzige, humorvolle und leicht chaotische Bindung zwischen einem kleinen Kind und den Erwachsenen um sie herum betont. Jedes Kapitel präsentiert kurze, in sich abgeschlossene Episoden, die Monakas ungefilterte Sicht auf die Welt, ihre schelmischen Streiche und die zärtlichen Momente hervorheben, die aus ihren Interaktionen mit Chiseko und dem Rest der Familie entstehen.