In einer Welt, in der das Konzept sekundärer Geschlechter wie Alpha, Beta und Omega nicht existiert, führt der Oberschüler Takai Shikito ein ruhiges Leben. Er ist belesen, wissenschaftlich neugierig und hält bewusst ein niedriges Profil, obwohl er heimlich seinen charismatischen und beliebten Mitschüler Nishio Ririto bewundert. An einem gewöhnlichen Tag bemerkt Takai einen ungewöhnlich verführerischen Duft, der von Nishio ausgeht. Später, während des Sportunterrichts, wird Nishio von einer seltsamen, fiebrigen Hitze überwältigt. Besorgt versucht Takai, ihn ins Krankenzimmer zu begleiten, doch die beiden werden stattdessen in einen abgelegenen Geräteraum der Turnhalle gezogen. Dort, getrieben von einem überwältigenden, unbekannten Instinkt, werden sie zum ersten Mal körperlich intim.

Keiner der Jungen versteht, was mit ihren Körpern geschieht. Nishios Hitze lässt nicht nach, sodass er gezwungen ist, sieben Tage lang im Geräteraum versteckt zu bleiben. Takai bringt Essen, Vorräte und Ausreden für ihre Abwesenheit, während sich sein eigener Körper zu verändern beginnt: Seine Sinne schärfen sich, sein Sehvermögen verbessert sich, ein Knoten bildet sich an seinem Penis, und er verspürt einen starken Drang, Nishios Nacken zu beißen. Die Jungen erkennen allmählich, dass sie etwas noch nie Dagewesenes erleben. Gestützt auf sein Wissen über Tierverhalten und Biologie vermutet Takai, dass sie ein Phänomen durchmachen, das dem Bindungsystem eines Wolfsrudels ähnelt. Nishios Gedanken und Gefühle beginnen, direkt in Takais Geist überzutragen und schaffen eine psychische Verbindung zwischen ihnen.

Nishio stammt aus einer Patchworkfamilie; seine Mutter hat wieder geheiratet, und er kämpft still mit dem Gefühl, nicht wirklich dazuzugehören. Takai, der Sohn eines Arztes, ist sanftmütig und intellektuell angetrieben, aber die in ihm erwachenden Alpha-Instinkte bringen Besitzdenken, Territorialverhalten und ein heftiges Bedürfnis hervor, Nishio zu beschützen. Die Geschichte folgt ihrer sich entwickelnden Beziehung, während sie die körperlichen und emotionalen Turbulenzen bewältigen, die ersten Alpha und Omega der Welt zu sein, ohne einen gesellschaftlichen Rahmen, der sie leitet. Ihr siebentägiger Aufenthalt im Geräteraum wird zu einem Schmelztiegel, in dem Instinkt, Verletzlichkeit und Zuneigung zusammenfließen.

Die Erzählung weitet sich später über diese erste Woche hinaus aus. Als sie zum Schulalltag zurückkehren, müssen Takai und Nishio ihre fortlaufende Bindung bewältigen – die periodischen Hitzen, die telepathische Verbindung und den sozialen Druck, ihren Zustand zu verheimlichen. Ihre Familien, Freundschaften und Zukünfte werden alle beeinflusst, während sie zu den unbeabsichtigten Pionieren einer neuen Stufe der menschlichen Evolution werden. Die Serie zeichnet ihr Wachstum von verwirrten Teenagern zu einem Paar nach, das trotz des Fehlens eines göttlichen Bauplans sein eigenes Eden erschafft.