Japan verfällt. Rezession, eine rapide alternde Bevölkerung, endemische Korruption und geheime schwarze Kassen haben die Nation von innen heraus ausgehöhlt. In dieser Atmosphäre des Niedergangs widmet sich der Geheimagent der Erdverteidigungsstreitkräfte, Yamato Koichi, der Gefangennahme außerirdischer Lebensformen, in der Überzeugung, dass die Beseitigung dieser außerirdischen Bedrohungen der Schlüssel zur Wiederherstellung des nationalen Friedens ist. Seine Überzeugung wird erschüttert, als er eine mysteriöse Frau trifft, die einer außerirdischen Lebenskraft angehört, einer Alien-Gruppe, deren Heimatwelt zerstört wurde. Sie stellt eine verheerende Frage: Was ist es wirklich, das aus Japan vertrieben werden muss? Ihre Worte zwingen Koichi, sich einem anderen und weitaus heimtückischeren Feind zu stellen – der tief verwurzelten, unverantwortlichen Korruption und der mächtigen, parasitären alten Garde, die das Gesetz nicht erreichen kann.

Koichi verbündet sich mit dieser Alien-Frau, bekannt als Piroko, und gemeinsam begeben sie sich auf einen gewaltsamen Kreuzzug, um Japan von seinen „老害“ (rougai) zu befreien – der tief verwurzelten, schädlichen alten Elite. Ihr erstes großes Ziel ist Premierminister Hayashimichi Akira, dessen Ermordung sie inszenieren. Als das Paar von gezielten Tötungen zu offenem politischem Aufstand eskaliert, werden sie von einer speziellen Maßnahmeeinheit unter der Leitung von Shinano bekämpft, während sich eine parallele Handlung um einen unschuldigen Mittelschüler namens Nagito entfaltet, dessen Schwester von einem Transun-Alien entführt wurde. Nagitos verzweifelte, persönliche Suche, seine Schwester zurückzuholen, kollidiert mit Koichis und Pirokos großem, ideologischem Säuberungsfeldzug.

Der zentrale Konflikt der Geschichte erreicht seinen Höhepunkt auf dem Boden des Nationalen Parlamentsgebäudes. Drei unvereinbare Kräfte prallen aufeinander: Koichi und Piroko als die „Nachtwache“, die die alte Garde exekutieren; die Erdverteidigungsstreitkräfte, die das Massenschlachten stoppen wollen; und Nagito, der nur seine Schwester befreien will. Ihre Konfrontation löst einen dramatischen Führungswechsel aus, als ein neuer nationaler Führer mit Versprechungen einer helleren Zukunft aufsteigt – Worte, die denen hohl erscheinen, die bereits den Preis für diese neue Ordnung gesehen haben. Die Serie erforscht den schmalen Grat zwischen Patriotismus und Mord und fragt, ob eine Gesellschaft gerettet werden kann, indem genau die Rechtsstaatlichkeit geopfert wird, die sie definiert.