Kizuki Ken ist ein Oberschüler mit einem ungewöhnlichen Hobby: Er baut detailgetreue Puppenhäuser. Eines Morgens öffnet er das selbstgebaute Puppenhaus und findet darin einen handtellergroßen, bedrohlich aussehenden Mann stehen. Der winzige Mann, der sich als Ginji vorstellt, behauptet, aus dem Weltall zu kommen, und bittet Ken um Hilfe. Ginji gehört zu einer Gruppe kleiner, yakuzaähnlicher Aliens namens Oniyadori-gumi und braucht ein neues Zuhause. Ken, von der Situation gerührt, willigt ein, Ginji zu helfen, eine geeignete Unterkunft zu finden oder zu bauen. Es folgt eine Comedy des Alltags, in der Kens ruhige Welt des Miniaturhausbaus durch die Ankunft von Ginji und anderen winzigen, lärmenden Aliens auf den Kopf gestellt wird, die ihre eigenen Forderungen, Traditionen und ihren Unfug mitbringen. Die Geschichte entfaltet sich, während Ken versucht, eine passende „Hülle“ für Ginji zu bauen und sich gleichzeitig mit den chaotischen, aber liebenswerten Eskapaden der Miniaturgangster auseinandersetzt. Spätere Bände führen weitere außerirdische Besucher und eskalierende Komplikationen ein, wie einen Streik im Puppenhaus und einen unerwarteten Besuch des Bosses der Gruppe, während Ken darum kämpft, sein Schulleben und seine wachsende Verantwortung für seine interstellaren Mitbewohner unter einen Hut zu bringen.