"Sword Art Online: Project Alicization (Manga)" ist eine Adaption des gleichnamigen Light-Novel-Arcs und setzt die Geschichte von Kirito in einer neuen virtuellen Welt fort. Nach den Ereignissen der vorherigen Arcs wird Kirito in ein geheimes Projekt namens "Alicization" involviert, das von der Regierung entwickelt wurde, um eine hoch entwickelte künstliche Intelligenz zu erschaffen. Dabei wird er in eine virtuelle Welt namens "Underworld" transferiert, die sich von allen bisherigen Spielwelten unterscheidet. Diese Welt simuliert eine mittelalterliche Gesellschaft, in der die Bewohner, sogenannte "Fluctlights", über ein eigenes Bewusstsein verfügen und ein vollständiges Leben führen.

In Underworld erwacht Kirito als Kind und wächst in einem kleinen Dorf auf, ohne Erinnerungen an seine wahre Identität. Er freundet sich mit Eugeo an, einem Jungen, der sein engster Vertrauter wird. Die beiden beschließen, das Dorf zu verlassen, um eine alte Aufgabe zu erfüllen: ein magisches Schwert zu bergen, das von einem mächtigen Baum bewacht wird. Auf ihrer Reise treffen sie auf Herausforderungen, die ihre Freundschaft und ihren Mut auf die Probe stellen. Gleichzeitig wird deutlich, dass Underworld nicht nur eine einfache Simulation ist, sondern ein Schlüssel zur Entwicklung von künstlicher Intelligenz, die die reale Welt beeinflussen könnte.

Im weiteren Verlauf der Handlung wird Kiritos wahre Identität wiederhergestellt, und er erkennt die Gefahren, die mit dem Alicization-Projekt verbunden sind. Er muss sich gegen mächtige Gegner stellen, darunter Administrator, die Herrscherin von Underworld, und ihre Untergebenen, die die Kontrolle über die Welt anstreben. Unterstützung erhält Kirito von alten Verbündeten wie Asuna, die ebenfalls in Underworld eintritt, um ihn zu retten. Die Handlung thematisiert ethische Fragen rund um künstliche Intelligenz, das Bewusstsein und die Grenzen zwischen virtueller und realer Welt.

Die Charaktere sind zentral für die Entwicklung der Geschichte. Kirito bleibt der Protagonist, dessen Fähigkeiten und Entschlossenheit im Mittelpunkt stehen. Eugeo entwickelt sich von einem naiven Dorfjungen zu einem entscheidenden Akteur, der seine eigenen moralischen Konflikte bewältigen muss. Asuna spielt eine wichtige Rolle, sowohl als Kiritos Unterstützerin als auch als eigenständige Figur, die ihre Stärke und Entschlossenheit unter Beweis stellt. Antagonisten wie Administrator und ihre Gefolgsleute tragen zur Komplexität der Handlung bei, indem sie die Grenzen von Macht und Kontrolle in einer virtuellen Welt ausloten.

Die Handlung verbindet Action, emotionale Tiefe und philosophische Fragestellungen, während sie die Beziehungen zwischen den Charakteren und ihre Entwicklung in einer sich ständig verändernden Welt erforscht. Der Manga bleibt dabei eng an der Vorlage der Light Novel und bietet eine visuelle Darstellung der intensiven Kämpfe, der detaillierten Welt und der emotionalen Momente, die die Serie auszeichnen.