"Apple Children of Aeon" ist eine Manga-Serie, die in einer postapokalyptischen Welt spielt, in der die Menschheit durch eine mysteriöse Katastrophe fast vollständig ausgelöscht wurde. Die Überlebenden leben in einer düsteren, von Ruinen geprägten Landschaft, in der Ressourcen knapp sind und das Überleben täglich neu erkämpft werden muss. Im Zentrum der Handlung steht eine Gruppe von Kindern, die als "Apfelkinder" bezeichnet werden. Diese Kinder besitzen besondere Fähigkeiten, die sie von den übrigen Überlebenden unterscheiden, und werden von einer geheimnisvollen Organisation namens Aeon verfolgt und manipuliert.

Die Protagonisten, darunter die Hauptfiguren Luka und Aria, sind auf der Flucht vor Aeon, das die Kinder für seine eigenen Zwecke einsetzen will. Luka, ein Junge mit einer rätselhaften Vergangenheit, und Aria, ein Mädchen mit übernatürlichen Kräften, bilden das Herz der Gruppe. Ihre Beziehung entwickelt sich im Laufe der Geschichte, während sie gemeinsam gegen die Bedrohungen ihrer Welt kämpfen. Die Serie erforscht Themen wie Vertrauen, Verrat und die moralischen Dilemmata, die in einer Welt entstehen, in der das Überleben oft auf Kosten anderer geht.

Die Handlung wird durch eine Reihe von Rückblenden und Enthüllungen vorangetrieben, die die Hintergründe der Charaktere und die Ursprünge der Katastrophe beleuchten. Dabei wird deutlich, dass die Apfelkinder eine Schlüsselrolle in der möglichen Rettung oder Zerstörung der verbliebenen Menschheit spielen könnten. Die Serie verbindet Action, Drama und Science-Fiction-Elemente, wobei die Charakterentwicklung und die komplexen Beziehungen zwischen den Figuren im Vordergrund stehen. Die düstere Atmosphäre und die moralischen Fragen, die die Serie aufwirft, tragen zu einer intensiven und fesselnden Erzählung bei.