Die Mangaserie "Rockman X" basiert auf der gleichnamigen Videospielreihe und spielt in einer futuristischen Welt, in der humanoide Roboter, genannt Reploids, eine zentrale Rolle spielen. Die Handlung beginnt mit der Entdeckung des Protagonisten X, eines fortschrittlichen Reploids, der von Dr. Light geschaffen wurde. X wird von Dr. Cain, einem Wissenschaftler, aktiviert und in eine Welt voller Konflikte geworfen. X zeichnet sich durch seine Fähigkeit aus, moralische Entscheidungen zu treffen, was ihn von anderen Reploids unterscheidet.

Die Geschichte konzentriert sich auf den Kampf zwischen den Mavericks, rebellischen Reploids, die eine Bedrohung für die Menschheit darstellen, und den Maverick Hunters, einer Organisation, die gegründet wurde, um diese Bedrohung zu bekämpfen. X schließt sich den Maverick Hunters an und wird zu einem ihrer wichtigsten Mitglieder. Zusammen mit seinem Partner Zero, einem rothaarigen Reploid mit außergewöhnlichen Kampffähigkeiten, setzt er sich gegen die Mavericks ein. Zero ist ein komplexer Charakter, dessen Vergangenheit und wahre Natur im Laufe der Serie immer wieder thematisiert werden.

Der Hauptantagonist der Serie ist Sigma, ein ehemaliger Anführer der Maverick Hunters, der sich gegen die Menschheit wendet und die Mavericks anführt. Sigma strebt danach, eine neue Weltordnung zu schaffen, in der Reploids die dominierende Spezies sind. X und Zero müssen sich immer wieder Sigma und seinen Verbündeten stellen, darunter auch Vile, ein skrupelloser Maverick, der X und Zero wiederholt herausfordert.

Die Handlung ist geprägt von intensiven Kämpfen, moralischen Dilemmata und der Erkundung der Beziehung zwischen Mensch und Maschine. Themen wie Freiheit, Verantwortung und die Natur des Bewusstseins werden durch die Charaktere und ihre Entscheidungen erforscht. Die Serie bleibt dabei eng an den Grundlagen der Videospielvorlage, während sie gleichzeitig die Hintergründe der Charaktere und die Welt, in der sie leben, vertieft.

Im Laufe der Serie entwickelt sich X von einem unsicheren Reploid zu einem entschlossenen Kämpfer, der seine Rolle als Beschützer der Menschheit annimmt. Zero hingegen kämpft mit seiner eigenen Identität und den Erinnerungen an seine Vergangenheit, was ihn zu einem der faszinierendsten Charaktere der Serie macht. Die Dynamik zwischen X und Zero bildet das emotionale Zentrum der Geschichte und trägt maßgeblich zur Spannung und Tiefe der Handlung bei.