"EUREKA SEVEN AO (Manga)" ist eine Adaption der gleichnamigen Anime-Serie und spielt in einer Welt, die von mysteriösen Kreaturen, den sogenannten Scub Corals, und politischen Konflikten geprägt ist. Die Handlung konzentriert sich auf Ao Fukai, einen jungen Protagonisten, der auf der Insel Iwato Jima lebt. Ao ist der Sohn von Eureka und Renton, den Hauptfiguren der ursprünglichen "EUREKA SEVEN"-Serie, doch seine Eltern sind seit Jahren verschwunden. Ao wächst bei seiner Großmutter auf und führt ein scheinbar normales Leben, bis die Insel von einer Bedrohung heimgesucht wird.

Die Geschichte nimmt Fahrt auf, als Ao auf ein mysteriöses Mädchen namens Naru trifft, das mit den Scub Corals in Verbindung zu stehen scheint. Gleichzeitig taucht eine geheimnisvolle Organisation namens Generation Bleu auf, die sich mit der Bekämpfung der Scub Corals beschäftigt. Ao wird in die Aktivitäten dieser Gruppe hineingezogen, als er einen speziellen Roboter, den Nirvash, aktiviert. Dieser Roboter ist eng mit den Scub Corals verbunden und verleiht Ao die Fähigkeit, gegen die Bedrohungen zu kämpfen, die die Welt in Gefahr bringen.

Im Laufe der Handlung wird deutlich, dass die Scub Corals nicht nur eine Bedrohung darstellen, sondern auch eine tiefere Verbindung zur Erde und ihrer Geschichte haben. Ao muss sich mit seiner eigenen Vergangenheit auseinandersetzen und herausfinden, was mit seinen Eltern geschehen ist. Dabei wird er mit moralischen Dilemmata und den komplexen Beziehungen zwischen den verschiedenen Fraktionen konfrontiert, die um die Kontrolle über die Scub Corals kämpfen.

Die Charaktere sind vielfältig und tragen zur Entwicklung der Handlung bei. Neben Ao und Naru spielen Figuren wie Elena Peoples, eine Pilotin von Generation Bleu, und Truth, ein geheimnisvoller Antagonist, eine zentrale Rolle. Die Interaktionen zwischen den Charakteren und ihre persönlichen Motivationen fügen der Handlung Tiefe hinzu und verdeutlichen die ethischen Fragen, die im Mittelpunkt der Geschichte stehen.

Die Handlung ist geprägt von Action, politischen Intrigen und philosophischen Untertönen, die die Beziehung zwischen Menschheit und Natur sowie die Konsequenzen von Technologie und Fortschritt thematisieren. Der Manga bleibt dabei eng an der Vorlage des Anime, erweitert jedoch bestimmte Aspekte der Geschichte und bietet zusätzliche Einblicke in die Charaktere und ihre Hintergründe.